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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002174`

染色体: Chr01 坐标: 37814595-37817716 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002174`
名称	SmilChr01G002174
描述	gamma-glutamylcyclotransferase 2-3
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	37814595 - 37817716 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024087`
GeneID	`131024087`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024087`
原始查询	`LOC131024087`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	gamma-glutamylcyclotransferase 2-3
产物	gamma-glutamylcyclotransferase 2-3
Arabidopsis	`AT1G44790` (AT1G44790) ChaC-like family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841043] identity=72.4; qcov=0.989; evalue=2.06e-97; confidence=high
Rice	`Os04g0448600` - identity=68.4; qcov=0.947; evalue=1.04e-91; confidence=high
GO	GO:0003839 (gamma-glutamylcyclotransferase activity); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0006751 (glutathione catabolic process); GO:0061928 (glutathione specific gamma-glutamylcyclotransferase activity)
KEGG	smil00480 (Glutathione metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF04752 (ChaC)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024087

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057809633.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057809633.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057809633.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057809633.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057809633.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:37814714`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A1,B140
`Chr1:37814889`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C65
`Chr1:37816341`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B129,B38,B39,B53,C23
`Chr1:37817402`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B75,C74,C75
`Chr1:37817417`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C59
`Chr1:37817426`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D1
`Chr1:37817438`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B46,C14

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809633.1

187 aa

187

ChaC

PF04752 ChaC 1-177 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809633.1`	Pfam	`PF04752`	ChaC	Family	1	177	7.6e-54	183.1	ChaC-like protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953650.1
AACTTGGATTCACAAACTTTATGAAACCCCAAAATCACAGTTCCCTGACGTTGGGCTAATAATGATCAACTGAATTACCAACCAGCTGCACGAATCGCAAAAAGGCACGATCTTTATATAAAATTCTCAATGATTCGCTCCTATTTCTGCTGCGTGCTGTAGAAGATCTTCTTCTCTGCTCTCTCGCTCATCTGGGCTGCGGTTCCTGCTCCAGATTGAGTGAGAGAAAAACATAAAAAGTAGGAATCTTGGCGATGTGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131024087
ATGTGGGTATTCGGGTACGGGTCGCTGATATGGAAAGCGGGCTTCCCTTACGATGAGCGGGTCGTGGGTTTCATCAAGGATTACCGCCGTGTCTTCTACCAAGGAAGCACGGATCATAGAGGAACACCGGAGTTCCCTGGAAGAACAGTCACGTTGGAACCTGCAAAGGGCGAAGTCTGCTGGGGTGCTGCGTACAAGATAGTCAACAAGGAAGATCAACTAACTGCATTGGAGCATCTTGAGGTGAGAGAGAAGCAGTA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809633.1
MWVFGYGSLIWKAGFPYDERVVGFIKDYRRVFYQGSTDHRGTPEFPGRTVTLEPAKGEVCWGAAYKIVNKEDQLTALEHLEVREKQYDMKAYVDFFTDAASSTPFVSNVMVYIASADKKLNQNYLGPASLEEIAIQIVRAKGPSGPNREYLFKLESALIQIGCEDKHVRDLADEVRRILSLQGELID

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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