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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G003421`

染色体: Chr05 坐标: 45450664-45460402 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G003421`
名称	SmilChr05G003421
描述	nucleoside diphosphate kinase 3-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	45450664 - 45460402 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024512`
GeneID	`131024512`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024512`
原始查询	`LOC131024512`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	nucleoside diphosphate kinase 3-like
产物	nucleoside diphosphate kinase 3-like
Arabidopsis	`AT4G23900` (AT4G23900) Nucleoside diphosphate kinase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828490] identity=78.2; qcov=1.02; evalue=1.25e-130; confidence=high
Rice	`Os05g0595400` (OsNDPK3) - identity=71.1; qcov=0.991; evalue=9.99e-116; confidence=high
GO	GO:0004550 (nucleoside diphosphate kinase activity); GO:0006183 (GTP biosynthetic process); GO:0006228 (UTP biosynthetic process); GO:0006241 (CTP biosynthetic process)
KEGG	smil00230 (Purine metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00240 (Pyrimidine metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01232 (Nucleotide metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01240 (Biosynthesis of cofactors - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04016 (MAPK signaling pathway - plant - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00334 (NDK)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024512

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057810001.1`
2	Mitochondrion matrix	线粒体基质	0.20000	`XP_057810001.1`
3	Mitochondrion membrane	线粒体膜	0.20000	`XP_057810001.1`
4	Mitochondrion inner membrane	线粒体内膜	0.20000	`XP_057810001.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057810001.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:45450876`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr5:45459289`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A23,B44
`Chr5:45459611`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B54
`Chr5:45459772`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B21,B68,C35,C48
`Chr5:45459921`	`AAC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C2
`Chr5:45459921`	`AAC`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C2
`Chr5:45459961`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B135,B40

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810001.1

234 aa

117

234

NDK

PF00334 NDK 85-218 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810001.1`	Pfam	`PF00334`	NDK	Domain	85	218	8e-54	181.9	Nucleoside diphosphate kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954018.1
CTTTAATCTGAAGCAAATCAGTCAACAGTCCTAGTTGTAGATGCCCTTTTTTTGCGACTTCTGTTAAACTAAACACGTCCTTGTAAGGAAGGATACGTCTCTTCATAAAAACTCTCACTTCCCATTACTGTTTCTGCTTCAAAATTTGATCGTCTTATTCTCCAAAAATGAGGTCTCAGATTTCCAGATCTGCGAGGTCGCTCCTATCTTCTGCTTCCAAGCGCACAGCTCGATCATTTTCAGGTGGAGAAGCAGCAGCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131024512
ATGAGGTCTCAGATTTCCAGATCTGCGAGGTCGCTCCTATCTTCTGCTTCCAAGCGCACAGCTCGATCATTTTCAGGTGGAGAAGCAGCAGCTGCCGCTGGTGCAGTTACATGCAGAGGAAGAGTGTCATCTTTAGCTTCATACAGTTTATCGAAGTCGAGAAATGCATGTGGGGGTTGGATACCTGGACTCCTTGCCCTTCCTGCTGCAGCTTTCATGCTTCAAGAGCAGGAAGCACATGCTGCACAGATGGAGAGAAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057810001.1
MRSQISRSARSLLSSASKRTARSFSGGEAAAAAGAVTCRGRVSSLASYSLSKSRNACGGWIPGLLALPAAAFMLQEQEAHAAQMERTFIAIKPDGVQRGLISEIVSRFERKGFKLVGIKIIVPPKDFAQKHYHDLKDRPFFNGLCNFLSSGPVVAMVWEGEGVIRYGRKLIGATDPQKSEPGSIRADLAVVVGRNIIHGSDGPETAKDEIKLWFKPEELVCYTSNAEKWIYGTN

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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