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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002345`

染色体: Chr01 坐标: 40590469-40592688 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002345`
名称	SmilChr01G002345
描述	monooxygenase 2
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	40590469 - 40592688 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131024586`
GeneID	`131024586`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131024586`
原始查询	`LOC131024586`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	monooxygenase 2
产物	monooxygenase 2
Arabidopsis	`AT2G35660` (CTF2A) FAD/NAD(P)-binding oxidoreductase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818135] identity=71.5; qcov=1; evalue=3.95e-177; confidence=high
Rice	`Os07g0491900` - identity=62.4; qcov=1; evalue=1.47e-143; confidence=high
GO	GO:0071949 (FAD binding)
KEGG	-
Pfam	PF01494 (FAD_binding_3); PF05834 (Lycopene_cycl); PF13450 (NAD_binding_8)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131024586

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057810076.1`
2	Endoplasmic reticulum	内质网	0.60000	`XP_057810086.1`
3	Chloroplast membrane	叶绿体膜	0.60000	`XP_057810076.1`
4	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.40000	`XP_057810076.1`
5	Peroxisome	过氧化物酶体	0.20000	`XP_057810086.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:40590558`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	4	A24,B103,C9,D11
`Chr1:40590558`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A24,B103,C9,D11
`Chr1:40590567`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B110,B65,C13
`Chr1:40590574`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B82
`Chr1:40590589`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B83,C3,D3
`Chr1:40590595`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A9,B65,D11
`Chr1:40590616`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A24,B103,C9
`Chr1:40590627`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A3,B68,C3
`Chr1:40590650`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A3,B68,C3
`Chr1:40590652`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B10,B114,C50,C51,C55
`Chr1:40590654`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A1,B130,C29
`Chr1:40590703`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A1,A19,C29,D5

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810076.1

437 aa

218

437

FAD_binding_3

Lycopene_cycl

NAD_binding_8

PF01494 FAD_binding_3 46-384 aa PF05834 Lycopene_cycl 47-237 aa PF13450 NAD_binding_8 49-92 aa

XP_057810086.1

323 aa

162

323

Lycopene_cycl

FAD_binding_3

PF05834 Lycopene_cycl 24-123 aa PF01494 FAD_binding_3 32-270 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810076.1`	Pfam	`PF01494`	FAD_binding_3	Domain	46	384	4.3e-25	89.4	FAD binding domain
`XP_057810076.1`	Pfam	`PF05834`	Lycopene_cycl	Family	47	237	3.8e-10	40.1	Lycopene cyclase protein
`XP_057810076.1`	Pfam	`PF13450`	NAD_binding_8	Domain	49	92	5.5e-05	24.1	NAD(P)-binding Rossmann-like domain
`XP_057810086.1`	Pfam	`PF05834`	Lycopene_cycl	Family	24	123	4.9e-06	26.6	Lycopene cyclase protein
`XP_057810086.1`	Pfam	`PF01494`	FAD_binding_3	Domain	32	270	2e-14	54.3	FAD binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954093.1
AAATATTTTAGTCCGAAATATAAAAAAATCGATTATGCTAAATTGAAAAGCCTGATTGACATCCCTACTTGGTGGTGTTGATATACAGTTTATGTCAACGCTGACTCTTGAAAGAAGCGGTTGAGTAGTTTGTATGTATGGTGTGGGAAGAAACCAACTGGTTGAAGGTCGGCCACTCGCTTGCTTCCACAAATTATGTTTATAATTATCACAACAACGCTCATCCATTTCAAACCCATCATGGCAAGCCTATTAACGCC...

XM_057954103.1
ATTGGGTCAGTGGTGGTTGAGCAAGGTGAGTCGCTGAGAATCGGCGGCACTTCGCTCACATTTTTCAAGAATGGATGGAAAGTATTTGATGCCATTGGAGTGGGAGCTGAGCTACGCTCCCAATTCCTCGAAATTGAAGGGGTGTGTGCAGGATGGTGGTGAAATCGGAGGGTGGCAGGGAGCTACGCTCCTTCAGATTCAAAGATGAGGACCAAAGCCAAGAGGTACGTGCTGTAGAAAGGAGAACTCTGTTGGAGACC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131024586
ATGTTTATAATTATCACAACAACGCTCATCCATTTCAAACCCATCATGGCAAGCCTATTAACGCCTCCAAAATGGCCCCTCACGCTTCCTTCACGCCGGCGATCCACGGTGGCGGCAACTGCTGTCAGGAAGGAAGAGATAGTGATCGTCGGAGCCGGAATTTCTGGCCTCGCCACTGCCGTTGCTCTTCAAAGAGTGGGAATTGGGTCAGTGGTGGTTGAGCAAGGTGAGTCGCTGAGAATCGGCGGCACTTCGCTCAC...

LOC131024586
ATGGTGGTGAAATCGGAGGGTGGCAGGGAGCTACGCTCCTTCAGATTCAAAGATGAGGACCAAAGCCAAGAGGTACGTGCTGTAGAAAGGAGAACTCTGTTGGAGACCCTCGCAAGCCGGCTGCCCTCCGCTGCCATTTCTTTCTCCTCAAAGCTTAAGCGCGTCGAAACGAGTCGCAACGACGGCGACACCCTCCTCACGCTCGAGGACGATTCTCTGATATCTGCTAAGATTGTTATAGCCTGTGATGGGATACGGTC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057810076.1
MFIIITTTLIHFKPIMASLLTPPKWPLTLPSRRRSTVAATAVRKEEIVIVGAGISGLATAVALQRVGIGSVVVEQGESLRIGGTSLTFFKNGWKVFDAIGVGAELRSQFLEIEGMVVKSEGGRELRSFRFKDEDQSQEVRAVERRTLLETLASRLPSAAISFSSKLKRVETSRNDGDTLLTLEDDSLISAKIVIACDGIRSPVAKWMGFPDPRYVGHCAFRGLGVYPDGQPFEPRVTYVYGRGVRAGYVPVSPTKVYWFI...

XP_057810086.1
MVVKSEGGRELRSFRFKDEDQSQEVRAVERRTLLETLASRLPSAAISFSSKLKRVETSRNDGDTLLTLEDDSLISAKIVIACDGIRSPVAKWMGFPDPRYVGHCAFRGLGVYPDGQPFEPRVTYVYGRGVRAGYVPVSPTKVYWFICFNSPFPGPKITDPSILRKEAENLVKEWPSELLSIIESTPDDTIIRTPLVDRWLWPGITPPASAGKVVLVGDAWHPMTPNLGQGACCALEDAVVLANKLGEAIKVGSMSVEEAF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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