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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G004049`

染色体: Chr05 坐标: 54481481-54486420 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G004049`
名称	SmilChr05G004049
描述	CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase 1
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	54481481 - 54486420 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025112`
GeneID	`131025112`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025112`
原始查询	`LOC131025112`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase 1
产物	CDP-diacylglycerol--serine O-phosphatidyltransferase 1
Arabidopsis	`AT1G15110` (PSS1) phosphatidyl serine synthase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838074] identity=78.8; qcov=0.998; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0118300` (SUI1) - identity=79.2; qcov=0.995; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0006659 (phosphatidylserine biosynthetic process); GO:0106245 (L-serine-phosphatidylethanolamine phosphatidyltransferase activity)
KEGG	smil00564 (Glycerophospholipid metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF03034 (PSS)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025112

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057810705.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	1.00000	`XP_057810705.1`
3	Vesicle	囊泡	0.20000	`XP_057810705.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057810705.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057810705.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:54482702`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B102
`Chr5:54482719`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C12,C3
`Chr5:54483176`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B104,B59,B67,B71,C11
`Chr5:54483756`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B122
`Chr5:54486127`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B122

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810705.1

426 aa

213

426

PSS

PF03034 PSS 102-383 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810705.1`	Pfam	`PF03034`	PSS	Family	102	383	1.2e-113	380.0	Phosphatidyl serine synthase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954722.1
AAAAGTTTGAATAAAATTTGTGAAAAGTATTTTATATCATAGAATATGGAACTTAATGGCCATCGGAGAGCTAGACGGAAGGTTCACGTGGCTTATCAAAATGGTGATTTGAGCACATCAAGTAGTGAAGACGAGCATGATCCATGGACTGCCTGGGCTTACAAGCCTCGCACAATTACATTATTACTAATTGGTGCATGCTTTCTTGTATGGGCAAGTGGAGCACTTGATCCAGAACGTGGTTCAGAAACTGAGCTTGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131025112
ATGGAACTTAATGGCCATCGGAGAGCTAGACGGAAGGTTCACGTGGCTTATCAAAATGGTGATTTGAGCACATCAAGTAGTGAAGACGAGCATGATCCATGGACTGCCTGGGCTTACAAGCCTCGCACAATTACATTATTACTAATTGGTGCATGCTTTCTTGTATGGGCAAGTGGAGCACTTGATCCAGAACGTGGTTCAGAAACTGAGCTTGTTACCTCTGTGAAAAGGGGTGTATGGGCGATGATCGCGGTGTTCCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057810705.1
MELNGHRRARRKVHVAYQNGDLSTSSSEDEHDPWTAWAYKPRTITLLLIGACFLVWASGALDPERGSETELVTSVKRGVWAMIAVFLAYCLLQAPSTILIRPHPAIWRLVHGMAVIYLVALTFLLFQKRDDARQFMRFLHPDLGVELPERSYGADCRIYVPENPTSRFKNVYETLFDEFVLAHILGWWGKAIMIRNQPLLWVLSIGFELMELTFRHMLPNFNECWWDSIILDIFICNWFGIWAGMRTVRYFDGRTYEWVG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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