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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及有 accession 序列支持的文献基因名查询；未闭环名称仅提供候选导航。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G004173`

染色体: Chr05 坐标: 55659909-55662451 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G004173`
名称	SmilChr05G004173
描述	homeobox-leucine zipper protein ATHB-13-like
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	55659909 - 55662451 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131025227`
GeneID	`131025227`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131025227`
原始查询	`LOC131025227`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	homeobox-leucine zipper protein ATHB-13-like
产物	homeobox-leucine zipper protein ATHB-13-like
Arabidopsis	`AT1G69780` (ATHB13) Homeobox-leucine zipper protein family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843314] identity=62.03; qcov=1.0; evalue=3.88e-118; confidence=high
Rice	`Os10g0404900` (Oshox23) - identity=68.75; qcov=0.471; evalue=8.05e-56; confidence=medium
GO	GO:0000981 (DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific); GO:0005634 (nucleus); GO:0043565 (sequence-specific DNA binding); GO:0045893 (positive regulation of DNA-templated transcription)
KEGG	-
Pfam	PF00046 (Homeodomain); PF02183 (HALZ)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131025227

打开注释模块

非零投票定位候选（最多五项）

Rank	定位位置	中文	五折投票比例	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057810875.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:55660924`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B132,B28,B68
`Chr5:55661044`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C7
`Chr5:55661044`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C7
`Chr5:55661048`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C7
`Chr5:55661071`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr5:55661155`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B13,B97
`Chr5:55661191`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B13,B89,B97
`Chr5:55661194`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B13,B89,B97,C3
`Chr5:55661210`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B13,B89,B97
`Chr5:55661210`	`CA`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B13,B89,B97
`Chr5:55661234`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B13,B89
`Chr5:55661891`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B19,B58,C48

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057810875.1

274 aa

137

274

Homeodomain

HALZ

PF00046 Homeodomain 82-135 aa PF02183 HALZ 137-178 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057810875.1`	Pfam	`PF00046`	Homeodomain	Domain	82	135	4.3e-16	59.2	Homeodomain
`XP_057810875.1`	Pfam	`PF02183`	HALZ	Coiled-coil	137	178	6.4e-16	59.0	Homeobox associated leucine zipper

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057954892.1
ACTTTTTGAAAAATTAAATCCTTTTCTTTTTTGCCCCCTCTTATAAGTCACCAACTTCTCCTTTTAAAAACCATGTACAAATCTCTTTAGCAAGGAATCAAACCGATGCAAATTTCAATGCCAACTGTCGACAGTAGAAAAAATATGCAGCCCACTTCACACATTAAATTAAAATATATGTCAAATTTCCCCCAATTTTTTTAAAATTTGATCGCTGTCTTTTTTTTCCGCAAGTTCACAACTATTAATCTCCAAATTCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

lcl|NC_080391.1_cds_XP_057810875.1_30137
ATGGCCTTCTTTCACTCCAATTTCATGCTTCAAATCCCTCATCAAGATGAACACAGCCAGCCTTCAACATCTCTAGCCCCAATTCTTCCCCCTCACGATTTTCATGGAGTGGCTTCGCTGCTAGCAAAGAGGCCTCAGACGATGGCGTTCTCGAGCGGCATCGAGGAGGAGATGCACAACAACAACAACGGCGGCAGCGTCGGGGACGACGACTTCTCCGACGACGGGTCGCAGATCGGGGAGAAGAAGCGGCGGCTGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057810875.1
MAFFHSNFMLQIPHQDEHSQPSTSLAPILPPHDFHGVASLLAKRPQTMAFSSGIEEEMHNNNNGGSVGDDDFSDDGSQIGEKKRRLNMEQVKTLEKNFELGNKLEPERKMQLARALGLQPRQIAIWFQNRRARWKTKQLEKDYEILKRQFEAVKAENDALHSHNHKLHAQIVALKNREPTESINLNKETEGSCSNRSENSSENVKLDISRTQAIDSPISGRQLFPPSLRPAAAQQLFHNSKMEHAVKEESLCNMFVGMDD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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