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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002564`

染色体: Chr01 坐标: 43760740-43764339 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002564`
名称	SmilChr01G002564
描述	cucumisin-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	43760740 - 43764339 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131026081`
GeneID	`131026081`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131026081`
原始查询	`LOC131026081`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	cucumisin-like
产物	cucumisin-like
Arabidopsis	`AT5G59190` (AT5G59190) subtilase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836037] identity=47.8; qcov=0.917; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os06g0624100` (OsSub51) - identity=43; qcov=0.935; evalue=3.03e-164; confidence=medium
GO	GO:0004252 (serine-type endopeptidase activity); GO:0006508 (proteolysis)
KEGG	-
Pfam	PF00082 (Peptidase_S8); PF05922 (Inhibitor_I9); PF17766 (fn3_6)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131026081

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	0.80000	`XP_057811842.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.40000	`XP_057811842.1`
3	Vacuole	液泡	0.40000	`XP_057811842.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057811842.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057811842.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:43761025`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B9
`Chr1:43761060`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B128,B52,C2,C34,C36
`Chr1:43761355`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B128,C77,C81
`Chr1:43761519`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C85
`Chr1:43761576`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:43761591`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A5,C45,C61
`Chr1:43761865`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C77
`Chr1:43761874`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B115,B123,B16,B42
`Chr1:43762079`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B9
`Chr1:43762265`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B128,C77
`Chr1:43762371`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B3,C18
`Chr1:43762473`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B31,C11,C60

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057811842.1

781 aa

390

781

Inhibitor_I9

Peptidase_S8

fn3_6

PF05922 Inhibitor_I9 30-107 aa PF00082 Peptidase_S8 128-578 aa PF17766 fn3_6 633-739 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057811842.1`	Pfam	`PF05922`	Inhibitor_I9	Domain	30	107	7e-17	62.6	Peptidase inhibitor I9
`XP_057811842.1`	Pfam	`PF00082`	Peptidase_S8	Domain	128	578	4.6e-49	168.0	Subtilase family
`XP_057811842.1`	Pfam	`PF17766`	fn3_6	Domain	633	739	1.2e-21	77.5	Fibronectin type-III domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057955859.1
ACAAGTCTTAAGAAGATAAAACCACCAGATCAAACCAACTGAGTCTAATCAAAATGGCGAAAACCGGCCTCTTTTCACTTCTCTATCCTTTGCTGCTTGCAGCCCTTGTGCTCAACTGCCACTGCCTAGAAAGGAAGCTTCATGTAGTCTACATGGGAGATCGACCTGAAGAAGGTGTATCAGTTGTTTCCAAGCATCACGGAATGTTGCATAGAGTACTTGGAAGTGCCTCAGCAGCCAAAGACTCACTGGTCCACAGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131026081
ATGGCGAAAACCGGCCTCTTTTCACTTCTCTATCCTTTGCTGCTTGCAGCCCTTGTGCTCAACTGCCACTGCCTAGAAAGGAAGCTTCATGTAGTCTACATGGGAGATCGACCTGAAGAAGGTGTATCAGTTGTTTCCAAGCATCACGGAATGTTGCATAGAGTACTTGGAAGTGCCTCAGCAGCCAAAGACTCACTGGTCCACAGTTATGGAAGAAGTTTCAATGGATTTGCGGCCAAGCTCACAGACGAGGAAGCCAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057811842.1
MAKTGLFSLLYPLLLAALVLNCHCLERKLHVVYMGDRPEEGVSVVSKHHGMLHRVLGSASAAKDSLVHSYGRSFNGFAAKLTDEEATRISEMEGVVSVNPSRKHKLHTTRSWDFLNLTTDKLQAAPESDVVIGLLDTGVWPEHPSFNDTGFSSPPTKWKGTCAGTNFTCNNKIIGARFYHSDDQYYNGDVPSARDTEGHGTHTASTAAGVEVDASYFGVAAGKARGGVPSSRIAVYKVCWSDGCSDADILKAFDDAIADG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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