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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr05G002475`

染色体: Chr05 坐标: 27249475-27253207 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr05G002475`
名称	SmilChr05G002475
描述	allantoate deiminase 2
染色体 / SeqID	Chr05 / NC_080391.1
坐标与链方向	27249475 - 27253207 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131026249`
GeneID	`131026249`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131026249`
原始查询	`LOC131026249`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	allantoate deiminase 2
产物	allantoate deiminase 2
Arabidopsis	`AT4G20070` (AAH) allantoate amidohydrolase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827752] identity=72.5; qcov=0.947; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os06g0665500` (OsAAH) - identity=62; qcov=1; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0016813 (hydrolase activity, acting on carbon-nitrogen (but not peptide) bonds, in linear amidines)
KEGG	smil00230 (Purine metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01546 (Peptidase_M20); PF04389 (Peptidase_M28); PF07687 (M20_dimer)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131026249

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	0.80000	`XP_057812029.1`
2	Mitochondrion	线粒体	0.20000	`XP_057812029.1`
3	Mitochondrion matrix	线粒体基质	0.20000	`XP_057812029.1`
4	Endoplasmic reticulum lumen	内质网腔	0.20000	`XP_057812029.1`
5	Peroxisome	过氧化物酶体	0.20000	`XP_057812029.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr5:27249621`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B9
`Chr5:27249776`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	D10,D11
`Chr5:27250235`	`ATC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C11
`Chr5:27250235`	`ATC`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C11
`Chr5:27250300`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C43
`Chr5:27250444`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A24,B94
`Chr5:27250973`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B99
`Chr5:27251572`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B24,B93
`Chr5:27252079`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B130,B136,C33

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057812029.1

472 aa

236

472

Peptidase_M28

Peptidase_M20

M20_dimer

PF04389 Peptidase_M28 92-175 aa PF01546 Peptidase_M20 109-465 aa PF07687 M20_dimer 248-362 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057812029.1`	Pfam	`PF04389`	Peptidase_M28	Domain	92	175	4.5e-09	37.0	Peptidase family M28
`XP_057812029.1`	Pfam	`PF01546`	Peptidase_M20	Family	109	465	5.8e-16	59.7	Peptidase family M20/M25/M40
`XP_057812029.1`	Pfam	`PF07687`	M20_dimer	Domain	248	362	2.2e-08	34.7	Peptidase dimerisation domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057956046.1
ATGGGGGGCTGAGGAGGAGTATCAAGTGGGCCCAGCTTTTCCGAAACGAGACACAGAGTCACGAGGCAGGGACGAAGCAGCCACAATCGCTGGCCGCCATGACCTCACAATTCCACCACCTTTTTATTTTAGATTGAATGCATTTCCGTGATTAAACTTTCTGCTTCCTCTTTCGAAGCTGCGTCTTCTCCAATGCCGCCGATTCTCCATCTCTCCCTTTCGATCTCTCTCTTCCTCGTTTTACTAACTGCCTCCACTAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131026249
ATGCCGCCGATTCTCCATCTCTCCCTTTCGATCTCTCTCTTCCTCGTTTTACTAACTGCCTCCACTAACGGATTTTCTGAAGAGAAGAACCTTTTGCATTCGGAAATACTAAAGGATGAGGCAGTGGCAAGACTTTTTGAGCTTGGAAAGGTGAGTGATTCAGAAGAATTTCTTGAGAGAACTTTCCAATCTGCAGCTTCTTTAAGAGCAGGAACTCTTATTAGGAGATGGATGGAGGATGCAGGATTGCAGACGTGGGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057812029.1
MPPILHLSLSISLFLVLLTASTNGFSEEKNLLHSEILKDEAVARLFELGKVSDSEEFLERTFQSAASLRAGTLIRRWMEDAGLQTWVDQMGNVHGRHEGLNPREKALLIGSHLDTVIDAGVFDGALGIITALSALKVLKIRGMLGNLKRPVEVIAFSDEEGVRFQSTFLGSAAIAGVLPVSTLQVHDKSGVTVQGALRMNSIDISEDNLLQLKYDPESVYGYVEVHIEQGPVLENAGLPLGLVKGIAGQTRLKVTVKGTQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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