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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000013`

染色体: Chr01 坐标: 286077-286661 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000013`
名称	SmilChr01G000013
描述	uncharacterized SmilChr01G000013
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	286077 - 286661 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006430`
GeneID	`131006430`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006430`
原始查询	`SmilChr01G000013`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os12g0142900; species=rice; confidence=weak
产物	hit=Os12g0142900; species=rice; confidence=weak
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os12g0142900` - identity=24.2; qcov=1; evalue=6.44e-08; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF08284 (RVP_2); PF13650 (Asp_protease_2); PF13975 (gag-asp_proteas); PF30863 (PRO_PEG10-RTL1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006430

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057789582.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057789582.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057789582.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057789582.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057789582.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:286236`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B138,C4,C49,C6,C9
`Chr1:286310`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B71
`Chr1:286310`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B71
`Chr1:286321`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A24
`Chr1:286323`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B64,C21
`Chr1:286341`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B113,B127,C32
`Chr1:286355`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B97,C14
`Chr1:286355`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B97,C14
`Chr1:286385`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A1,B105
`Chr1:286413`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B118,B97,C14
`Chr1:286419`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B46
`Chr1:286434`	`AAC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	3	B110,C31,C60

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789582.1

194 aa

194

RVP_2

Asp_protease_2

gag-asp_proteas

PRO_PEG10-RTL1

PF08284 RVP_2 5-108 aa PF13650 Asp_protease_2 7-90 aa PF13975 gag-asp_proteas 8-92 aa PF30863 PRO_PEG10-RTL1 12-108 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789582.1`	Pfam	`PF08284`	RVP_2	Domain	5	108	8.9e-26	91.0	Retroviral aspartyl protease
`XP_057789582.1`	Pfam	`PF13650`	Asp_protease_2	Domain	7	90	2.4e-06	28.9	Aspartyl protease
`XP_057789582.1`	Pfam	`PF13975`	gag-asp_proteas	Domain	8	92	6.9e-07	30.5	gag-polyprotein putative aspartyl protease
`XP_057789582.1`	Pfam	`PF30863`	PRO_PEG10-RTL1	Domain	12	108	1.9e-08	35.4	PEG10/RTL1 protease domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933599.1
ATGGATACGCTACTCAGCACGCCTGTTATACTTTTGTTCGACACGAGTACTTCACATTCTTTCATTTCAAGTGCATGCGTCGACACTCTAGAACTCAAACAGGAAAGTGCTAATCAGGATATGAGAATTTCTTCACCAATAGGAGGGGTGACGACAGTTACACACGTTTGCTCGAACTTAGATTTGAACATAAGATCACTTAAGGTTGTAGTGAACAACTTGCATGTTATACCAATATGGGACGTGGACGTAATCCTAGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131006430
ATGGATACGCTACTCAGCACGCCTGTTATACTTTTGTTCGACACGAGTACTTCACATTCTTTCATTTCAAGTGCATGCGTCGACACTCTAGAACTCAAACAGGAAAGTGCTAATCAGGATATGAGAATTTCTTCACCAATAGGAGGGGTGACGACAGTTACACACGTTTGCTCGAACTTAGATTTGAACATAAGATCACTTAAGGTTGTAGTGAACAACTTGCATGTTATACCAATATGGGACGTGGACGTAATCCTAGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057789582.1
MDTLLSTPVILLFDTSTSHSFISSACVDTLELKQESANQDMRISSPIGGVTTVTHVCSNLDLNIRSLKVVVNNLHVIPIWDVDVILGMDWLAENYATILCKEREISFKYPGKDALSFHGISMDRNIPIISALQARKKMNKKDCRAFLVYLDGEAGTERAIEDVKVVREYNDVFPDNLPGLPPNRQVEFTIELEP

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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