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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000067`

染色体: Chr01 坐标: 1111480-1112546 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000067`
名称	SmilChr01G000067
描述	uncharacterized SmilChr01G000067
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	1111480 - 1112546 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006454`
GeneID	`131006454`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006454`
原始查询	`SmilChr01G000067`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815861]; symbol=AT2G13770; hit=AT2G13770; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815861]; symbol=AT2G13770; hit=AT2G13770; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT2G13770` (AT2G13770) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815861] identity=40.3; qcov=0.867; evalue=2.54e-41; confidence=medium
Rice	`Os01g0872900` - identity=53.8; qcov=0.426; evalue=5.49e-30; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04827 (Plant_tran)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006454

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057789597.1`
2	Chromosome	染色体	0.20000	`XP_057789597.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057789597.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057789597.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057789597.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:1111494`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D1
`Chr1:1111497`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A24,D1
`Chr1:1111499`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:1111507`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	56	A1,A14,A20,A21,A24,A8,B106,B120,B126,B127,B128,B129,B133,B136,B15,B22,B23,B29,B3,B50,B51,B63,B65,B66,B68,B74,B79,B8,B80,B85,B86,B88,B95,C1,C12,C14,C19,C2,C26,C28,C31,C37,C42,C43,C44,C45,C62,C65,C76,C8,C82,C87,C9,D11,D6,D7
`Chr1:1111508`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	57	A1,A14,A20,A21,A24,A8,B106,B120,B126,B127,B128,B129,B133,B136,B15,B22,B23,B29,B3,B50,B51,B63,B65,B66,B68,B74,B79,B8,B85,B86,B88,B95,C1,C12,C14,C16,C19,C2,C26,C28,C3,C31,C37,C42,C43,C44,C45,C62,C65,C76,C8,C82,C87,C9,D11,D6,D7
`Chr1:1111537`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B65,D1
`Chr1:1111578`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A16,B41,B74
`Chr1:1111580`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D1
`Chr1:1111593`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B32,B36
`Chr1:1111616`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B134,B138,B31,B33
`Chr1:1111653`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B134,B138,B31,B33
`Chr1:1111654`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B71

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789597.1

249 aa

124

249

Plant_tran

PF04827 Plant_tran 120-184 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789597.1`	Pfam	`PF04827`	Plant_tran	Family	120	184	4.6e-23	82.6	Plant transposon protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933614.1
ATGCCGATTTCGTACGCGGCGTGCATTATTTTGCGCATTGTCAACGCGGTGCAGTCCGATCCGTACTTCCAACAACGTGCGAATGCACTTGGCAGATCCGGCTTCACACCATTGCATAAATGCACGGTTGCTATTCGTATGCTAGCAAATGGAGGTGCAGCTGACCAGTACGACGAGTATCTACGGGTTGCGAAGTCTACCTTATTGGAGTGCATGTGTAGATTCTGTCGAGTCATCAACCAACTCTTCGGCGTGGAATA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131006454
ATGCCGATTTCGTACGCGGCGTGCATTATTTTGCGCATTGTCAACGCGGTGCAGTCCGATCCGTACTTCCAACAACGTGCGAATGCACTTGGCAGATCCGGCTTCACACCATTGCATAAATGCACGGTTGCTATTCGTATGCTAGCAAATGGAGGTGCAGCTGACCAGTACGACGAGTATCTACGGGTTGCGAAGTCTACCTTATTGGAGTGCATGTGTAGATTCTGTCGAGTCATCAACCAACTCTTCGGCGTGGAATA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057789597.1
MPISYAACIILRIVNAVQSDPYFQQRANALGRSGFTPLHKCTVAIRMLANGGAADQYDEYLRVAKSTLLECMCRFCRVINQLFGVEYLRRPTPADCQRLVAMHEEKHGFPGMLEKSYTSNAKSKRLKVIQEPARKDIERAVGVLQARWAIIKGPPRLWSKEELSDIMFTCIHLHNMIIQDEGEHATEWEEEGNDEASSSSAAARPCTGAPPEFRAYVARQASMRDAEVHARLTWDLKEHIWSRFGPIKP

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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