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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000074`

染色体: Chr01 坐标: 1298878-1302762 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000074`
名称	SmilChr01G000074
描述	L-cysteine desulfhydrase
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	1298878 - 1302762 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131007216`
GeneID	`131007216`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131007216`
原始查询	`SmilChr01G000074`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	L-cysteine desulfhydrase
产物	L-cysteine desulfhydrase
Arabidopsis	`AT3G62130` (LCD) Pyridoxal phosphate (PLP)-dependent transferases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825386] identity=68.2; qcov=0.984; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0290100` - identity=62.5; qcov=0.951; evalue=0; confidence=high
GO	-
KEGG	smil00270 (Cysteine and methionine metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00266 (Aminotran_5)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131007216

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057790351.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057790351.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057790351.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057790351.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057790351.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:1301568`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B125,B90,B92
`Chr1:1302111`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B138,C15
`Chr1:1302308`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr1:1302410`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B134
`Chr1:1302410`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B134
`Chr1:1302413`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B134
`Chr1:1302413`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B134
`Chr1:1302432`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B54

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790351.1

451 aa

226

451

Aminotran_5

PF00266 Aminotran_5 84-273 aa

XP_057790352.1

451 aa

226

451

Aminotran_5

PF00266 Aminotran_5 84-273 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057790351.1`	Pfam	`PF00266`	Aminotran_5	Domain	84	273	7.3e-18	65.4	Aminotransferase class-V
`XP_057790352.1`	Pfam	`PF00266`	Aminotran_5	Domain	84	273	7.3e-18	65.4	Aminotransferase class-V

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934369.1
TAGTGAGTAGTGAGGAGTAAATAAGGCAAGGCGGGGCGGGGCATGGATAAGGGAAACGGTGAATGGAAAGCAGAGTTTTCCCCAAATTAGTGAAACGCAGCAGCGGTTAACTTGCCGCTCCCAAAACCCTAATCTAATCATCCCTCCTTGGGCGCCGATGGCCGGAATCGAAGACCCTCGCGCCGCCGCTAACGGCGACACCCCCCACGCCTTGAAGAAGCCCAAACTCTCTTTTATTACGGAATCGGAACTCCGCGAAG...

XM_057934368.1
GTAGTGAGGAGTAAATAAGGCAAGGCGGGGCGGGGCATGGATAAGGGAAACGGTGAATGGAAAGCAGAGTTTTCCCCAAATTAGTGAAACGCAGCAGCGGTTAACTTGCCGCTCCCAAAACCCTAATCTAATCATCCCTCCTTGGGCGCCGATGGCCGGAATCGAAGACCCTCGCGCCGCCGCTAACGGCGACACCCCCCACGCCTTGAAGAAGCCCAAACTCTCTTTTATTACGGAATCGGAACTCCGCGAAGAATTCG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131007216
ATGGCCGGAATCGAAGACCCTCGCGCCGCCGCTAACGGCGACACCCCCCACGCCTTGAAGAAGCCCAAACTCTCTTTTATTACGGAATCGGAACTCCGCGAAGAATTCGGCCACCACCAGTCCGGAATCGCCCGACTCAACAACGGCAGCTTCGGCAGCTGCCCTGCCTCCATCATCGCTGCCCAGAGAAGATGGCAGCTCCGGTTCCTCCGCCAACCCGACGACTTCTTCTTCAATCACCTCCAGCCTCAGATAATCCA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057790351.1
MAGIEDPRAAANGDTPHALKKPKLSFITESELREEFGHHQSGIARLNNGSFGSCPASIIAAQRRWQLRFLRQPDDFFFNHLQPQIIQSRAVIKDLINADHVDEVSIVDNATTAAAIVLQHVGWAFAEGRFQKGDAVVMLHCAFQAVKKSIEAYVTRAGGSVIVVHLPFPVNSNEEIIAEFRKGLARGKANGKKVRLAIIDHITSMPCVVIPARELVRICREEGVERVFVDAAHAIGNIHVDVKEIGADFYVSNLHKWFFC...

XP_057790352.1
MAGIEDPRAAANGDTPHALKKPKLSFITESELREEFGHHQSGIARLNNGSFGSCPASIIAAQRRWQLRFLRQPDDFFFNHLQPQIIQSRAVIKDLINADHVDEVSIVDNATTAAAIVLQHVGWAFAEGRFQKGDAVVMLHCAFQAVKKSIEAYVTRAGGSVIVVHLPFPVNSNEEIIAEFRKGLARGKANGKKVRLAIIDHITSMPCVVIPARELVRICREEGVERVFVDAAHAIGNIHVDVKEIGADFYVSNLHKWFFC...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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