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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000083`

染色体: Chr01 坐标: 1577219-1585906 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000083`
名称	SmilChr01G000083
描述	protein translocase subunit SECA1, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	1577219 - 1585906 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131007220`
GeneID	`131007220`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131007220`
原始查询	`SmilChr01G000083`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein translocase subunit SECA1, chloroplastic
产物	protein translocase subunit SECA1%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT4G01800` (AGY1) Albino or Glassy Yellow 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827922] identity=84.1; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os11g0195100` - identity=47.1; qcov=0.937; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005524 (ATP binding); GO:0006605 (protein targeting); GO:0015462 (ABC-type protein transporter activity); GO:0016020 (membrane); GO:0017038 (protein import)
KEGG	smil03060 (Protein export - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00270 (DEAD); PF01043 (SecA_PP_bind); PF07516 (SecA_SW); PF07517 (SecA_DEAD); PF21090 (P-loop_SecA)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131007220

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057790354.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.80000	`XP_057790354.1`
3	Chloroplast thylakoid	类囊体	0.80000	`XP_057790355.1`
4	Chloroplast thylakoid membrane	类囊体膜	0.20000	`XP_057790354.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057790354.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:1577576`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C15
`Chr1:1578151`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B50
`Chr1:1580841`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B138
`Chr1:1581503`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B134,B138,B31,B33
`Chr1:1581713`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C57
`Chr1:1582716`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B41,B74,C18
`Chr1:1582782`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B138,B2,C15,D10
`Chr1:1582945`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B21,B41,B74,C18
`Chr1:1583412`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A1,B105,B44,C21,C73
`Chr1:1585745`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C61

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790354.1

1008 aa

504

1008

SecA_DEAD

DEAD

SecA_PP_bind

P-loop_SecA

SecA_SW

PF07517 SecA_DEAD 76-444 aa PF00270 DEAD 160-277 aa PF01043 SecA_PP_bind 294-400 aa PF21090 P-loop_SecA 459-748 aa PF07516 SecA_SW 750-966 aa

XP_057790355.1

845 aa

422

845

SecA_DEAD

DEAD

SecA_PP_bind

P-loop_SecA

SecA_SW

PF07517 SecA_DEAD 76-444 aa PF00270 DEAD 160-277 aa PF01043 SecA_PP_bind 294-400 aa PF21090 P-loop_SecA 459-748 aa PF07516 SecA_SW 750-845 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057790354.1`	Pfam	`PF07517`	SecA_DEAD	Domain	76	444	1.5e-124	415.7	SecA DEAD-like domain
`XP_057790354.1`	Pfam	`PF00270`	DEAD	Domain	160	277	1.7e-08	35.1	DEAD/DEAH box helicase
`XP_057790354.1`	Pfam	`PF01043`	SecA_PP_bind	Domain	294	400	3e-39	134.7	SecA preprotein cross-linking domain
`XP_057790354.1`	Pfam	`PF21090`	P-loop_SecA	Domain	459	748	2.2e-82	276.4	SecA P-loop domain
`XP_057790354.1`	Pfam	`PF07516`	SecA_SW	Family	750	966	8.2e-56	190.0	SecA Wing and Scaffold domain
`XP_057790355.1`	Pfam	`PF07517`	SecA_DEAD	Domain	76	444	1.1e-124	416.1	SecA DEAD-like domain
`XP_057790355.1`	Pfam	`PF00270`	DEAD	Domain	160	277	1.3e-08	35.5	DEAD/DEAH box helicase
`XP_057790355.1`	Pfam	`PF01043`	SecA_PP_bind	Domain	294	400	6e-39	133.8	SecA preprotein cross-linking domain
`XP_057790355.1`	Pfam	`PF21090`	P-loop_SecA	Domain	459	748	1.5e-82	276.9	SecA P-loop domain
`XP_057790355.1`	Pfam	`PF07516`	SecA_SW	Family	750	845	6.5e-27	95.6	SecA Wing and Scaffold domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934371.1
GACAGACGACAGAGCTTATTATCATAGGTGGATAAATGATAATTATGAAGCGAGCAAGGTGGCCTTATCGGTTGCGTAAAATTGAGACCTCATTTTCCCTCTCACAAATTCAGACCTTCTCTGCTAACCACAGTTATGGCAGTTGCTCCGCGGCTCGCCGCCGGCCACTGCCCCTCCATCGCAGCCACCTCAGTGTCTTCTAAGTTCACCGTCTCAAGAGCCAGCAATTGGTTGGTGTTTGATGTTGGAGCTAAACCCCT...

XM_057934372.1
GACAGACGACAGAGCTTATTATCATAGGTGGATAAATGATAATTATGAAGCGAGCAAGGTGGCCTTATCGGTTGCGTAAAATTGAGACCTCATTTTCCCTCTCACAAATTCAGACCTTCTCTGCTAACCACAGTTATGGCAGTTGCTCCGCGGCTCGCCGCCGGCCACTGCCCCTCCATCGCAGCCACCTCAGTGTCTTCTAAGTTCACCGTCTCAAGAGCCAGCAATTGGTTGGTGTTTGATGTTGGAGCTAAACCCCT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131007220
ATGGCAGTTGCTCCGCGGCTCGCCGCCGGCCACTGCCCCTCCATCGCAGCCACCTCAGTGTCTTCTAAGTTCACCGTCTCAAGAGCCAGCAATTGGTTGGTGTTTGATGTTGGAGCTAAACCCCTCAGAGCTAGAGCAAGGGGCGTGGGCAGAAGGAGGTGGGCCCCAGTGGCGGCATTGGGCGGATTGCTCGGCGGGATTTTCGGAGGTGGCACGGACACCGGAGAGTCTACCAGACAGAGTTATGCTAGCACCGTATC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057790354.1
MAVAPRLAAGHCPSIAATSVSSKFTVSRASNWLVFDVGAKPLRARARGVGRRRWAPVAALGGLLGGIFGGGTDTGESTRQSYASTVSLINKMESEISSLSDSQLRERTCTLQQRAARGDSLDSILPEAFAVVREASKRVLGLRPFDVQLIGGMVLHKGEIAEMKTGEGKTLVAILPAFLNALAGKGVHVVTVNDYLARRDCEWVGQVPRFLGLKVGLIQQNMTSEQRRENYSCDITYVTNSEMGFDYLRDNLATSVEELV...

XP_057790355.1
MAVAPRLAAGHCPSIAATSVSSKFTVSRASNWLVFDVGAKPLRARARGVGRRRWAPVAALGGLLGGIFGGGTDTGESTRQSYASTVSLINKMESEISSLSDSQLRERTCTLQQRAARGDSLDSILPEAFAVVREASKRVLGLRPFDVQLIGGMVLHKGEIAEMKTGEGKTLVAILPAFLNALAGKGVHVVTVNDYLARRDCEWVGQVPRFLGLKVGLIQQNMTSEQRRENYSCDITYVTNSEMGFDYLRDNLATSVEELV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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