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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000161`

染色体: Chr01 坐标: 2701038-2701469 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000161`
名称	SmilChr01G000161
描述	uncharacterized SmilChr01G000161
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	2701038 - 2701469 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016598`
GeneID	`131016598`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016598`
原始查询	`SmilChr01G000161`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	pectinesterase (Protein of unknown function, DUF538) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839308]; symbol=AT1G02816; hit=AT1G02816; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	pectinesterase (Protein of unknown function, DUF538) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839308]; symbol=AT1G02816; hit=AT1G02816; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT1G02816` (AT1G02816) pectinesterase (Protein of unknown function, DUF538) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839308] identity=50; qcov=0.937; evalue=2.96e-48; confidence=medium
Rice	`Os05g0362500` - identity=48.9; qcov=0.944; evalue=4.45e-44; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04398 (DUF538)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016598

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	1.00000	`XP_057801617.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057801617.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057801617.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057801617.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057801617.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:2701266`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B138,B19,B33,C14,C37
`Chr1:2701296`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B56,B96,C8,D6
`Chr1:2701326`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B101,B2,B65,B75
`Chr1:2701447`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B53

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057801617.1

143 aa

143

DUF538

PF04398 DUF538 18-125 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057801617.1`	Pfam	`PF04398`	DUF538	Family	18	125	1.2e-35	123.1	Protein of unknown function, DUF538

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057945634.1
ATGCTGGTGTGTGTTAACGTCTCAGCCCAATATGACCCTAACAAGGCTTCAGCTTACGAAGCTCTGCAGCGATACGAGTTTCCGGTGGGGCTTCTGCCGGAAGGCGTGAGCGGATACAGCCTGAATGAGTCGAGCGGGGAGTTCTGGGCCCATCTCAACCGCTCGTGCAGCTTCACGTTGGAGAACTCGTACGAGCTCCGGTACGAGCCGGAGATCAAAGGGTTGCTATCGAAAGGGCGGCTTGAGAAGCTGAGCGGCGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131016598
ATGCTGGTGTGTGTTAACGTCTCAGCCCAATATGACCCTAACAAGGCTTCAGCTTACGAAGCTCTGCAGCGATACGAGTTTCCGGTGGGGCTTCTGCCGGAAGGCGTGAGCGGATACAGCCTGAATGAGTCGAGCGGGGAGTTCTGGGCCCATCTCAACCGCTCGTGCAGCTTCACGTTGGAGAACTCGTACGAGCTCCGGTACGAGCCGGAGATCAAAGGGTTGCTATCGAAAGGGCGGCTTGAGAAGCTGAGCGGCGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057801617.1
MLVCVNVSAQYDPNKASAYEALQRYEFPVGLLPEGVSGYSLNESSGEFWAHLNRSCSFTLENSYELRYEPEIKGLLSKGRLEKLSGVSVKVVLVWLNIVQVKRNRQSLHFSVGFKSADFPVENFEECPRCGCGFDCSSSSNYI

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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