当前解析结果
SmilChr01G000181| 统一新 Gene ID | SmilChr01G000181 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G000181 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr01G000181 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 3129296 - 3131235 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131025928 |
|---|---|
| GeneID | 131025928 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131025928 |
| 原始查询 | SmilChr01G000181 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os03g0439900; species=rice; confidence=low |
| 产物 | hit=Os03g0439900; species=rice; confidence=low |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | Os03g0439900- identity=29.1; qcov=0.421; evalue=4.23e-24; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131025928 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057811877.1 |
| 2 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.80000 | XP_057811877.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.60000 | XP_057811877.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057811877.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057811877.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:3129306 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B31,C40 |
Chr1:3129308 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A11,C59 |
Chr1:3129314 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B68,C4 |
Chr1:3129315 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C14,C69 |
Chr1:3129320 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C14,C69 |
Chr1:3129342 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C74 |
Chr1:3129350 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B75 |
Chr1:3129357 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | C17,C62,C69,D2 |
Chr1:3129381 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 44 | A25,B100,B103,B117,B120,B125,B14,B18,B23,B29,B30,B33,B35,B41,B44,B46,B59,B6,B60,B63,B72,B75,B8,B85,B86,B90,B91,B97,C13,C14,C18,C21,C24,C3,C37,C39,C56,C63,C67,C77,C79,C83,C9,D8 |
Chr1:3129454 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D11 |
Chr1:3129484 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C9 |
Chr1:3129522 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B23 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。