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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000205`

染色体: Chr01 坐标: 3546780-3552556 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000205`
名称	SmilChr01G000205
描述	fumarate hydratase 1, mitochondrial
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	3546780 - 3552556 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131007306`
GeneID	`131007306`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131007306`
原始查询	`SmilChr01G000205`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	fumarate hydratase 1, mitochondrial
产物	fumarate hydratase 1%2C mitochondrial
Arabidopsis	`AT2G47510` (FUM1) fumarase 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819364] identity=88.4; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0337900` - identity=87.3; qcov=0.951; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004333 (fumarate hydratase activity); GO:0005739 (mitochondrion); GO:0006099 (tricarboxylic acid cycle); GO:0006106 (fumarate metabolic process); GO:0006108 (malate metabolic process); GO:0045239 (tricarboxylic acid cycle heteromeric enzyme complex)
KEGG	smil00020 (Citrate cycle (TCA cycle) - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00620 (Pyruvate metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01200 (Carbon metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00206 (Lyase_1); PF10415 (FumaraseC_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131007306

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057790429.1`
2	Mitochondrion matrix	线粒体基质	1.00000	`XP_057790429.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057790429.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057790429.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057790429.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:3547701`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B32,B36
`Chr1:3549439`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B126,B9,B95,C44
`Chr1:3552312`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B71,D10
`Chr1:3552330`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B82,C14
`Chr1:3552338`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790429.1

488 aa

244

488

Lyase_1

FumaraseC_C

PF00206 Lyase_1 36-366 aa PF10415 FumaraseC_C 432-484 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057790429.1`	Pfam	`PF00206`	Lyase_1	Domain	36	366	8.1e-118	394.1	Lyase
`XP_057790429.1`	Pfam	`PF10415`	FumaraseC_C	Domain	432	484	8e-23	81.3	Fumarase C C-terminus

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934446.1
TGTTAATTGTTAGTAAGTAGCATTACTATTTACTATTGTCGAGAAGTAAATCAAACTACGATTCGTCCATTTCTGTTCTGAATTTTCGTCTCTGTTTTTCATTTGTCGCGGCGGCGACAGCCAAACCAACAACCGATCGCAGCGGCGGAAATTTGACTCCGGCAATGGCGATGCTGATAGCCAGCCGTCGGGCATCTTCTACGACGTCGTACTTGAGAGCGAGCTTCAGATGCTATTCATCGTCGTTTAGAGAAGAGAGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131007306
ATGGCGATGCTGATAGCCAGCCGTCGGGCATCTTCTACGACGTCGTACTTGAGAGCGAGCTTCAGATGCTATTCATCGTCGTTTAGAGAAGAGAGAGACACCTTTGGCCCCATTCAAGTTCCATCCGACAAATTATGGGGTGCCCAAACTCAGAGATCGTTGCAGAACTTTGAGATCGGAGGCGAGAGGGAAAGGATGCCTGAACCAATCATACGTGCATTCGGGATTCTTAAGAAATGTGCCGCAAAGGTAAACATAGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057790429.1
MAMLIASRRASSTTSYLRASFRCYSSSFREERDTFGPIQVPSDKLWGAQTQRSLQNFEIGGERERMPEPIIRAFGILKKCAAKVNIGYGLDPAIGNAIMQAAQEVAEGKLNDHFPLVVWQTGSGTQSNMNANEVIANRAAEILGHKRGEKVVHPNDHVNRSQSSNDTFPTVMHIAAATEINSRLLPKLKQLHATLNAKSLEFSDIVKIGRTHTQDATPLTLGQEFSGYTTQVKYGIDRVLCTLPRIYQLAQGGTAVGTGL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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