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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000625`

染色体: Chr01 坐标: 13996797-13999470 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000625`
名称	SmilChr01G000625
描述	probable WRKY transcription factor 26
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	13996797 - 13999470 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006655`
GeneID	`131006655`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006655`
原始查询	`SmilChr01G000625`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable WRKY transcription factor 26
产物	probable WRKY transcription factor 26
Arabidopsis	`AT2G38470` (WRKY33) WRKY DNA-binding protein 33 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818429] identity=53.2; qcov=0.711; evalue=2.18e-104; confidence=high
Rice	`Os01g0826400` (OsWRKY24) - identity=47.8; qcov=0.97; evalue=1.72e-132; confidence=high
GO	GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0043565 (sequence-specific DNA binding)
KEGG	smil04016 (MAPK signaling pathway - plant - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04626 (Plant-pathogen interaction - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF03106 (WRKY)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006655

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057789803.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057789803.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057789803.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057789803.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057789803.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:13997202`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B130
`Chr1:13998485`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:13998711`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:13998805`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C46
`Chr1:13998991`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C83
`Chr1:13998991`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C83
`Chr1:13999063`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B113
`Chr1:13999079`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B104,B106,B52,C15,D11
`Chr1:13999118`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	11	A21,B106,B115,B13,B130,B131,B40,B52,C38,C42,D11
`Chr1:13999133`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B106,B52,D10
`Chr1:13999150`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A21,B130,B52,D11
`Chr1:13999157`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A21,B52,D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789803.1

526 aa

263

526

WRKY

PF03106 WRKY 209-265 aa PF03106 WRKY 382-439 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789803.1`	Pfam	`PF03106`	WRKY	Domain	209	265	2.3e-53	179.0	WRKY DNA -binding domain
`XP_057789803.1`	Pfam	`PF03106`	WRKY	Domain	382	439	2.3e-53	179.0	WRKY DNA -binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933820.1
ATCTATTATGTTCACCAAAATAGTCAAATATAACTCAGATATCCATGATTAGAAATTTAGAATATGCTTCCTCCCCTACCGGAAAAAATAAAATAAATATATAAAGATAAATTCGAGATAGAGAGCGAAGAAACGTATACATTTTCACTTTCACACTTGTCTTCCTACAAAATCATTTCCTCCGCCAATCATCCCTCCATTTCCTGCAACCTCTGCAAGCTCCTTCACATTCATGTCTTCAGCCTCTTTCACCAGCCTCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131006655
ATGTCTTCAGCCTCTTTCACCAGCCTCCTCACTTCCGACCACCACTCCACCACCACCTCCTCCGCCGTGGGCAGAGGCCTCGGTGATCGGATAGCACAGAGAACTGGCTCTGGGGTCCCCAAATTCAAGTCCCTGCCACCGCCTTCGCTGCCGATAACTCCCCCCTCCGCCGCCTCGCCTTCTTCCTGGTTCGCTATTCCGCCCGGCCTCAGTCCCGCTGAGCTTTTGGATTCTCCGATTCTTCTGTCCGCTTCCAACAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057789803.1
MSSASFTSLLTSDHHSTTTSSAVGRGLGDRIAQRTGSGVPKFKSLPPPSLPITPPSAASPSSWFAIPPGLSPAELLDSPILLSASNILPSPTTGTYPIQGFGWNSSFNTNQQEESKLERNNFSEFSFQTRKPLTSYNLGEETWNYQQSANQNVQSSVDKPITKSEVKQMQSYSPEVAAIQKNDQSCNAAQIEYNHYNQNQSSSQNRKSDDGYNWRKYGQKQVKGSENPRSYYKCTFANCSMKKKVEKDLDGQITEIVYKG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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