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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000785`

染色体: Chr01 坐标: 17066630-17072528 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000785`
名称	SmilChr01G000785
描述	methylsterol monooxygenase 2-2
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	17066630 - 17072528 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006789`
GeneID	`131006789`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006789`
原始查询	`SmilChr01G000785`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	methylsterol monooxygenase 2-2
产物	methylsterol monooxygenase 2-2
Arabidopsis	`AT1G07420` (SMO2-1) sterol 4-alpha-methyl-oxidase 2-1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837254] identity=85.8; qcov=0.97; evalue=1.34e-174; confidence=high
Rice	`Os07g0101500` (OsGL1-8) - identity=75.2; qcov=0.959; evalue=6.75e-151; confidence=high
GO	GO:0000254 (C-4 methylsterol oxidase activity); GO:0005506 (iron ion binding); GO:0016126 (sterol biosynthetic process); GO:0080065 (4-alpha-methyl-delta7-sterol oxidation)
KEGG	smil00100 (Steroid biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF04116 (FA_hydroxylase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006789

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057789910.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	1.00000	`XP_057789910.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057789910.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057789910.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057789910.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:17066819`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A24
`Chr1:17068923`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B110
`Chr1:17068984`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B102
`Chr1:17068989`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B134,B37
`Chr1:17068989`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B134,B37
`Chr1:17068997`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B15,B22,C25,D2
`Chr1:17069231`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B23
`Chr1:17069231`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B23

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789910.1

269 aa

134

269

FA_hydroxylase

PF04116 FA_hydroxylase 113-247 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789910.1`	Pfam	`PF04116`	FA_hydroxylase	Domain	113	247	3.2e-27	96.3	Fatty acid hydroxylase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933927.1
TCCCACTTGACAGTCTGTATGTCTGTCATCAACTCAATGGACCCGTCGTCAATTCCTCTCTCACTCCTAACTTAGTGCTCCTCAGTCCACACACACACACCCACGCTTCAAGTGATATCACCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCTTAGATCGCGTCACATTGCCCTTCAGTCACAATGGCTTCAGTCGTCGACTCTGCGTGGACGTATCTCATCACCCATTTTAGTGACTTTCAACTGGCTTGTCTTGGAAGCTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131006789
ATGGCTTCAGTCGTCGACTCTGCGTGGACGTATCTCATCACCCATTTTAGTGACTTTCAACTGGCTTGTCTTGGAAGCTTCTTTCTTCATGAGAGCATCTTTTTCTTGTCTGGACTTCCATTTATATTTATGGAAAGGGCTGGGTGGCTGAGCAGATACAAAATACAGACTAAGAATAACACACCTGCTGCCCAGGAGAAATGTATCTCTCGGCTATTGCTCTATCATTTTTGTGTCAATCTACCTGTTATGATTCTATC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057789910.1
MASVVDSAWTYLITHFSDFQLACLGSFFLHESIFFLSGLPFIFMERAGWLSRYKIQTKNNTPAAQEKCISRLLLYHFCVNLPVMILSYPIFTSMGMRSTLPLPSWKVISTQILFYFILEDFVFYWGHRILHTKWLYKHVHSVHHEYATPFGLTSEYAHPAEILFLGFATILGPAITGPHLITLWLWMVLRVLETVEAHCGYHFPWSFSNLLPLYGGADFHDYHHRLLYTKSGNYSSTFVYMDWIFGTDKGYRKLKELKSG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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