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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000853`

染色体: Chr01 坐标: 18412557-18414127 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000853`
名称	SmilChr01G000853
描述	aspartyl protease AED3-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	18412557 - 18414127 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006837`
GeneID	`131006837`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006837`
原始查询	`SmilChr01G000853`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	aspartyl protease AED3-like
产物	aspartyl protease AED3-like
Arabidopsis	`AT1G09750` (AT1G09750) Eukaryotic aspartyl protease family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837504] identity=64.1; qcov=0.938; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0186900` (OsAP25) - identity=53.5; qcov=0.941; evalue=3.99e-138; confidence=high
GO	GO:0004190 (aspartic-type endopeptidase activity); GO:0006508 (proteolysis)
KEGG	-
Pfam	PF00026 (Asp); PF14541 (TAXi_C); PF14543 (TAXi_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006837

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057789983.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057789983.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057789983.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057789983.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057789983.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:18412777`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B40,C55
`Chr1:18412870`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A22,B47,B63
`Chr1:18412902`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B25,D10
`Chr1:18412940`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B105,C29
`Chr1:18412946`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B71
`Chr1:18413110`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C45,C61
`Chr1:18413182`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C19,C38,C82
`Chr1:18413382`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr1:18413406`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	C31,D1
`Chr1:18413406`	`C`	`CT`	1bp_insertion	CDS_variant	2	C31,D1
`Chr1:18413433`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C19
`Chr1:18413433`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C19

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789983.1

439 aa

220

439

Asp

TAXi_N

TAXi_C

PF00026 Asp 98-435 aa PF14543 TAXi_N 99-262 aa PF14541 TAXi_C 285-434 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789983.1`	Pfam	`PF00026`	Asp	Domain	98	435	2e-20	74.2	Eukaryotic aspartyl protease
`XP_057789983.1`	Pfam	`PF14543`	TAXi_N	Domain	99	262	1.5e-34	120.4	Xylanase inhibitor N-terminal
`XP_057789983.1`	Pfam	`PF14541`	TAXi_C	Domain	285	434	1e-26	94.4	Xylanase inhibitor C-terminal

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934000.1
AAAAATAAAAATTTATTGAACGCTAATATATTAATATTTTCAATTCTCTACAACTTTTTTTGGTGCTCCCACCATCTCTCTACTTTTATCTATAAAATCCTCTTACAATATCTTGTAGCAACCATCGCCCTTATCCTCATCAAACAATCTAATGGAACACTCTTCCAATATTCTTGCAACATTAATCTTCTTCATTTGTCTCTCCACAGCTTGCAATGGTGCGGTTTTTGACCCATGTTCTTCTCCCGAATCGGATCTAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131006837
ATGGAACACTCTTCCAATATTCTTGCAACATTAATCTTCTTCATTTGTCTCTCCACAGCTTGCAATGGTGCGGTTTTTGACCCATGTTCTTCTCCCGAATCGGATCTATCCGTGATCCACATTTACGGTAAATGCTCACCGTTGGTGTCGCCCAAACCCGCCACTTCATGGGTTGACACCATCCTCACCATGGCCTCCAGCGACCCGAAAAGGGTTTCCTACTTGTCGAGCCTCGTCTCGCCGAAACCCGCCTCCGCCCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057789983.1
MEHSSNILATLIFFICLSTACNGAVFDPCSSPESDLSVIHIYGKCSPLVSPKPATSWVDTILTMASSDPKRVSYLSSLVSPKPASAPIAPGQVINTGNYVVRVKIGTPGQLFFVVLDTSNDAAWFPCSGCTGCSSTLFASNASSTYASLDCSVPECTQVSGVSCPTVGSGSCLFNRSYGSGSTLSATLSRDTLTLGNDAIPNYAFGCIHAVSGGSIPPQGLLGLGRGSMSLLSQTGSVYSGVFSYCLPSFKSYYFSGSLK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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