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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000950`

染色体: Chr01 坐标: 20135300-20137758 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000950`
名称	SmilChr01G000950
描述	uncharacterized SmilChr01G000950
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	20135300 - 20137758 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006918`
GeneID	`131006918`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006918`
原始查询	`SmilChr01G000950`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	2,3-bisphosphoglycerate-dependent phosphoglycerate mutase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824367]; symbol=AT3G52040; hit=AT3G52040; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	2,3-bisphosphoglycerate-dependent phosphoglycerate mutase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824367]; symbol=AT3G52040; hit=AT3G52040; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT3G52040` (AT3G52040) 2,3-bisphosphoglycerate-dependent phosphoglycerate mutase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824367] identity=58.9; qcov=1.02; evalue=3.99e-32; confidence=medium
Rice	`Os01g0271700` - identity=64.6; qcov=0.545; evalue=2.9e-16; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF09495 (DUF2462)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006918

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057790041.1`
2	Nucleolus	核仁	1.00000	`XP_057790041.1`
3	Mitochondrion	线粒体	0.20000	`XP_057790040.1`
4	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057790041.1`
5	Chloroplast	叶绿体	0.20000	`XP_057790040.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:20135404`	`ATC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	103	A15,A16,A18,A19,A2,A21,A3,A4,A6,A8,B1,B100,B101,B102,B104,B106,B108,B11,B110,B112,B113,B122,B124,B13,B130,B131,B132,B136,B139,B140,B19,B20,B23,B24,B27,B28,B29,B30,B31,B34,B35,B41,B44,B45,B50,B51,B53,B54,B60,B68,B7,B70,B74,B8,B80,B81,B83,B84,B87,B9,B95,B96,B97,B99,C15,C2,C22,C26,C27,C28,C34,C37,C39,C4,C41,C43,C48,C5,C50,C52,C54,C56,C58,C59,C6,C60,C64,C66,C68,C7,C70,C72,C75,C77,C8,C80,C84,C85,C9,D2,D3,D4,D9
`Chr1:20135483`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	6	A18,B110,B16,B6,B88,C22
`Chr1:20135545`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	55	A10,A24,A25,A5,A9,B1,B10,B101,B106,B117,B128,B132,B135,B137,B140,B17,B18,B20,B23,B33,B35,B42,B43,B46,B49,B5,B55,B56,B57,B61,B66,B69,B73,B75,B76,B79,B91,B93,B96,B98,C16,C17,C30,C36,C4,C49,C53,C57,C58,C61,C7,C78,C8,C9,D10
`Chr1:20135833`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C45
`Chr1:20135833`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C45
`Chr1:20135842`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B109
`Chr1:20137513`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A22

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790040.1

154 aa

154

DUF2462

PF09495 DUF2462 67-145 aa

XP_057790041.1

88 aa

DUF2462

PF09495 DUF2462 1-79 aa

XP_057790042.1

88 aa

DUF2462

PF09495 DUF2462 1-79 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057790040.1`	Pfam	`PF09495`	DUF2462	Family	67	145	5.5e-07	30.9	Protein of unknown function (DUF2462)
`XP_057790041.1`	Pfam	`PF09495`	DUF2462	Family	1	79	1.2e-07	33.1	Protein of unknown function (DUF2462)
`XP_057790042.1`	Pfam	`PF09495`	DUF2462	Family	1	79	1.2e-07	33.1	Protein of unknown function (DUF2462)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934058.1
GGAACCAAAAAGCCCAAAATTTAATTTAATAGTACTACTTTCGAAGAATGACGATGAAGTAGAATTTTTGTATGCGCCGCCGCCGCTGGATCTCACTTTCCCCAATCTCTCAAACTCTGCAAATTAAGAATCCGCCGCGTCCACTTCCGCTGTCGTCTCCAACTCGCACTGTCAACTCCCTCAAGGCTCTCTGTTGTCCGACGGTAGCCGCCCCCAGCCCTCGCCGGCTCCTTCAATCGACGGCGGAACTGCGGTAAGTT...

XM_057934057.1
CAAAAAGCCCAAAATTTAATTTAATAGTACTACTTTCGAAGAATGACGATGAAGTAGAATTTTTGTATGCGCCGCCGCCGCTGGATCTCACTTTCCCCAATCTCTCAAACTCTGCAAATTAAGAATCCGCCGCGTCCACTTCCGCTGTCGTCTCCAACTCGCACTGTCAACTCCCTCAAGGCTCTCTGTTGTCCGACGGTAGCCGCCCCCAGCCCTCGCCGGCTCCTTCAATCGACGGCGGAACTGCGAAGAGAGAATAG...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC131006918
ATGCGCCGCCGCCGCTGGATCTCACTTTCCCCAATCTCTCAAACTCTGCAAATTAAGAATCCGCCGCGTCCACTTCCGCTGTCGTCTCCAACTCGCACTGTCAACTCCCTCAAGGCTCTCTGTTGTCCGACGGTAGCCGCCCCCAGCCCTCGCCGGCTCCTTCAATCGACGGCGGAACTGCGAAGAGAGAATAGGAAAATGACGCAGAAGGGAAATCTCTTCAAAGGGCAGAAGAAAAAGAAATCAGTTCCTCTCAATCG...

LOC131006918
ATGACGCAGAAGGGAAATCTCTTCAAAGGGCAGAAGAAAAAGAAATCAGTTCCTCTCAATCGGCATGGCAAAATCACCCATACGCGAAAGGGGAAGAAAGTGGCCAAGCCATCAAAGGTCACCAAAGAGATGGATGCCGATAGGGAGGTGAGCAAGTTTATAAACCACTGCAATGAGATGAAAGCTGTGACAGTTGCTAATAAAGATGGTGGGCATTTGAGTATTGTTAAACTACCGGCAGATTCCTCAAGTGGCGCAAA...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057790040.1
MRRRRWISLSPISQTLQIKNPPRPLPLSSPTRTVNSLKALCCPTVAAPSPRRLLQSTAELRRENRKMTQKGNLFKGQKKKKSVPLNRHGKITHTRKGKKVAKPSKVTKEMDADREVSKFINHCNEMKAVTVANKDGGHLSIVKLPADSSSGAKK

XP_057790041.1
MTQKGNLFKGQKKKKSVPLNRHGKITHTRKGKKVAKPSKVTKEMDADREVSKFINHCNEMKAVTVANKDGGHLSIVKLPADSSSGAKK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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