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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000965`

染色体: Chr01 坐标: 20483415-20487119 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000965`
名称	SmilChr01G000965
描述	polyamine oxidase 1-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	20483415 - 20487119 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006929`
GeneID	`131006929`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006929`
原始查询	`SmilChr01G000965`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	polyamine oxidase 1-like
产物	polyamine oxidase 1-like
Arabidopsis	`AT5G13700` (PAO1) polyamine oxidase 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831215] identity=70.4; qcov=0.908; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os09g0368200` (PAOb) - identity=46.5; qcov=0.954; evalue=9.16e-148; confidence=high
GO	GO:0006598 (polyamine catabolic process); GO:0046592 (polyamine oxidase activity)
KEGG	smil00330 (Arginine and proline metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00410 (beta-Alanine metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01593 (Amino_oxidase); PF13450 (NAD_binding_8)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006929

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	0.40000	`XP_057790051.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057790051.1`
3	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057790051.1`
4	Peroxisome	过氧化物酶体	0.20000	`XP_057790051.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057790051.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:20483634`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B98
`Chr1:20483693`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B139,C30
`Chr1:20484155`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B122,B13,C39
`Chr1:20484474`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A22
`Chr1:20484495`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B111,B88,C18
`Chr1:20484624`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B32,D10
`Chr1:20485028`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr1:20485447`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B104,B32,B75,C42
`Chr1:20485632`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B103,B139,B31,C21

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790051.1

480 aa

240

480

NAD_binding_8

Amino_oxidase

PF13450 NAD_binding_8 13-81 aa PF01593 Amino_oxidase 18-430 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057790051.1`	Pfam	`PF13450`	NAD_binding_8	Domain	13	81	2e-13	51.1	NAD(P)-binding Rossmann-like domain
`XP_057790051.1`	Pfam	`PF01593`	Amino_oxidase	Domain	18	430	1.9e-73	249.0	Flavin containing amine oxidoreductase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934068.1
TTTTCTCCTTCACCATCAACTCTTCTCTCTTAATCACTGTATCATCTCAACTCTACTCGTTTCCTTATACAAAACTCTGTCTCTCTCTCTCTAGAGTTTCATGGGGAATCCCACACGAAGCAAATGCTCCGTTCTCATCGTCGGAGCCGGTATTTCTGGTATAACGGCGGCGAAGGTGCTGGCGGAGAATGGGGTGGAGGACTTTGTGATAGTGGAGGCGTCTGACAGAATAGGGGGCAGGCTGAGGAAGGAGGATTTCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131006929
ATGGGGAATCCCACACGAAGCAAATGCTCCGTTCTCATCGTCGGAGCCGGTATTTCTGGTATAACGGCGGCGAAGGTGCTGGCGGAGAATGGGGTGGAGGACTTTGTGATAGTGGAGGCGTCTGACAGAATAGGGGGCAGGCTGAGGAAGGAGGATTTCGGAGGAGTGGCGGTGGAGCTCGGCGCCGGTTGGATCGCCGGCGTCGGCGGAGACCAGACCAACCCTCTCTGGGAAATGGCGCGCCACGCTAACCTCCGCAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057790051.1
MGNPTRSKCSVLIVGAGISGITAAKVLAENGVEDFVIVEASDRIGGRLRKEDFGGVAVELGAGWIAGVGGDQTNPLWEMARHANLRTYFSDYSNARFNIYDNNGNIFPAGVAAEAYDKAVESAVEKLRDQESDSSSDETPPSPKRPIDLAIDFMLHDFEMAEVEPIPTYVDFGDSEFLVADERGYEHLVYEMAQTFLFTSAAKILDNRLQLNKVVREMQQSRKGVIVKTEDGSVYEANYVILSVSIGVLQSNLINFSPPL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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