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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001003`

染色体: Chr01 坐标: 21120302-21128904 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001003`
名称	SmilChr01G001003
描述	laccase-14-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	21120302 - 21128904 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006960`
GeneID	`131006960`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006960`
原始查询	`SmilChr01G001003`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	laccase-14-like
产物	laccase-14-like
Arabidopsis	`AT5G09360` (LAC14) laccase 14 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830795] identity=48.2; qcov=0.998; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0749700` (OsLAC10) - identity=48.7; qcov=1.04; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005507 (copper ion binding); GO:0046274 (lignin catabolic process); GO:0048046 (apoplast); GO:0052716 (hydroquinone:oxygen oxidoreductase activity)
KEGG	-
Pfam	PF00394 (Cu-oxidase); PF07731 (Cu-oxidase_2); PF07732 (Cu-oxidase_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006960

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057790084.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057790084.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057790084.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057790084.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057790084.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:21120424`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B16,B6,B88,C67
`Chr1:21120458`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B15
`Chr1:21120796`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B75,C8
`Chr1:21120796`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B75,C8
`Chr1:21127006`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	39	A1,A22,A3,A4,A8,B105,B109,B112,B119,B135,B139,B17,B31,B33,B34,B47,B52,B53,B58,B64,B80,B83,B84,B85,C17,C19,C20,C21,C26,C29,C36,C38,C52,C61,C78,C8,C82,D5,D9
`Chr1:21127053`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr1:21127096`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B100,B140
`Chr1:21127113`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B15,B75
`Chr1:21127155`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B15,B75
`Chr1:21127178`	`GTC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B57
`Chr1:21127178`	`GTC`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B57
`Chr1:21127206`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790084.1

561 aa

280

561

Cu-oxidase_3

Cu-oxidase

Cu-oxidase_2

PF07732 Cu-oxidase_3 37-148 aa PF00394 Cu-oxidase 164-312 aa PF07731 Cu-oxidase_2 433-544 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057790084.1`	Pfam	`PF07732`	Cu-oxidase_3	Domain	37	148	1e-39	136.0	Multicopper oxidase
`XP_057790084.1`	Pfam	`PF00394`	Cu-oxidase	Domain	164	312	1.3e-36	126.8	Multicopper oxidase
`XP_057790084.1`	Pfam	`PF07731`	Cu-oxidase_2	Domain	433	544	6.8e-41	140.0	Multicopper oxidase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934101.1
AAGTGGTAAGACCGACACTATAAATATGACACAAAAAACACTAACAGACAACAATAGTCATACATATTTACCACACACAAAAAAATAAAAAATGTTTTCGGCTACAAAGGCCTTCATTCTGTGCTACTTAGGTGTTATTATGATTGGAGGCGCAACGCAAGTTAATGCTTCAATTCGTTGTTGTACGTTTGAAGTGGTAAATTCTGCACACACTAGACTATGCACCAAAAAGACTATGCTGACCATAAATGGACAGTTCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131006960
ATGTTTTCGGCTACAAAGGCCTTCATTCTGTGCTACTTAGGTGTTATTATGATTGGAGGCGCAACGCAAGTTAATGCTTCAATTCGTTGTTGTACGTTTGAAGTGGTAAATTCTGCACACACTAGACTATGCACCAAAAAGACTATGCTGACCATAAATGGACAGTTCCCGGGGCCAACCATATATGCTAGGAGGGGAGATCTGATTACAATGAATATTGTGAATCGCGCCGATCAAAATATCAGCATCCACTGGCATGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057790084.1
MFSATKAFILCYLGVIMIGGATQVNASIRCCTFEVVNSAHTRLCTKKTMLTINGQFPGPTIYARRGDLITMNIVNRADQNISIHWHGVKMPQYPWSDGTNYVTQCPIEPGQKFTQQIILSDEEGTLWWHAHSDWARNSVYGAIVILPPRTESFPFPTPHAHLPPILIGEWWNTEIETVFKEFLETGRDPEVANAFLLNGQPGDLYPCSSQDTYKLRVEYGKTYLIRLVNAVLDNVMFFKIANHELTVVGADGAYTKPLTT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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