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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001136`

染色体: Chr01 坐标: 23153104-23157408 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001136`
名称	SmilChr01G001136
描述	ATP synthase subunit O, mitochondrial-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	23153104 - 23157408 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131007056`
GeneID	`131007056`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131007056`
原始查询	`SmilChr01G001136`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ATP synthase subunit O, mitochondrial-like
产物	ATP synthase subunit O%2C mitochondrial-like
Arabidopsis	`AT5G13450` (ATP5) delta subunit of Mt ATP synthase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831186] identity=54; qcov=0.983; evalue=2.41e-87; confidence=high
Rice	`Os06g0646500` - identity=59.4; qcov=0.992; evalue=4.28e-86; confidence=high
GO	GO:0000274 (GO:0000274); GO:0016020 (membrane); GO:0042776 (proton motive force-driven mitochondrial ATP synthesis); GO:0045261 (GO:0045261); GO:0046933 (proton-transporting ATP synthase activity, rotational mechanism)
KEGG	smil00190 (Oxidative phosphorylation - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00213 (OSCP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131007056

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057790187.1`
2	Mitochondrion membrane	线粒体膜	0.60000	`XP_057790187.1`
3	Mitochondrion inner membrane	线粒体内膜	0.60000	`XP_057790187.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057790187.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057790187.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:23153380`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B61,B65
`Chr1:23153393`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7
`Chr1:23153453`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B13,C39
`Chr1:23156608`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A9,C76
`Chr1:23156609`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B93
`Chr1:23156630`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B101,C16

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790187.1

241 aa

120

241

OSCP

PF00213 OSCP 59-230 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057790187.1`	Pfam	`PF00213`	OSCP	Family	59	230	4e-44	151.4	ATP synthase delta (OSCP) subunit

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934204.1
TATTAACCTAGGTAGCACCTAAATCCCATACATCCCGGGGTCAGAGGGTTCCGATTTTCCCTTCCCAATCTTTGAAAACGCAGTGTTTGAGCAGAGCACCCACCAAAAACACCTTGCAAGTCCCAGATTCAGGAAAGTTTAATCAGAAAAAAGAAATTCAGAATATCTGCAACGGCAATGGCAGGGCGATTAAGATCGGGTCTTCCTCTCCTCCGCCGAGCTCTCACCGCTGGTAACATCTCCTCCGCTCCGAAAGCCGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131007056
ATGGCAGGGCGATTAAGATCGGGTCTTCCTCTCCTCCGCCGAGCTCTCACCGCTGGTAACATCTCCTCCGCTCCGAAAGCCGTCGTTTGCCCTACTACCGAGTCCGCAAGGAGCTATGCTAGTGCCGCTCCTGCAAAGGAGAAGAAGGTCAAGGTGCCTGTGACGATGTTTGGGGTGTCTGGAAACTATGCTTCAGCGTTATATATCGCAGCAGTCAAAGCCAATACGCTGGACAAGGTTGAATCTGAGCTTCTTTCCCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057790187.1
MAGRLRSGLPLLRRALTAGNISSAPKAVVCPTTESARSYASAAPAKEKKVKVPVTMFGVSGNYASALYIAAVKANTLDKVESELLSLIEASKKSPTFSQFMKDLSVDADTRVKAITDICGQAKFSDITRNFLVIVAEAGRLGHVERMAQRFSELTMAHRGEVKATVTTVIALPPEEEKELKETLQYILGQGKKVKVEQKIDPSILGGLVVEFSQKVFDMSIRTRAAQMERFLRQPLNPDGN

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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