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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001273`

染色体: Chr01 坐标: 25418890-25424779 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001273`
名称	SmilChr01G001273
描述	dihydropyrimidinase
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	25418890 - 25424779 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016671`
GeneID	`131016671`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016671`
原始查询	`SmilChr01G001273`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	dihydropyrimidinase
产物	dihydropyrimidinase
Arabidopsis	`AT5G12200` (PYD2) pyrimidine 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831093] identity=78.5; qcov=0.983; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0807900` (P0702B09.41-1) - identity=76.7; qcov=0.894; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004157 (dihydropyrimidinase activity); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0005829 (cytosol); GO:0006208 (pyrimidine nucleobase catabolic process)
KEGG	smil00240 (Pyrimidine metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00410 (beta-Alanine metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00770 (Pantothenate and CoA biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01979 (Amidohydro_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016671

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	0.60000	`XP_057801366.1`
2	Secreted	分泌到胞外	0.20000	`XP_057801366.1`
3	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057801366.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057801366.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057801366.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:25419232`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A24,B33
`Chr1:25419505`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C20
`Chr1:25420169`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B62
`Chr1:25420714`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B60
`Chr1:25421978`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B60
`Chr1:25423615`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B72,B82,C83
`Chr1:25424263`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B23
`Chr1:25424338`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:25424647`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B62

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057801366.1

538 aa

269

538

Amidohydro_1

PF01979 Amidohydro_1 101-487 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057801366.1`	Pfam	`PF01979`	Amidohydro_1	Domain	101	487	9.5e-23	81.7	Amidohydrolase family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057945383.1
TCGCTCATCTCATCTCCAATGCCGCTACTCTCAACAAGTCAAACTGGTTGCAGATTCCTCACTCCCATTGATTGACGCTCATCTCCATTGCCGAATTGGAAATCAAGCTTGGTAAACAACTAAAAATGGACTCTTCTCTTGCTCAAATAGCTCCTTCAGCCCATCTCCTCATCATCGTTTTCCTTTCACTCCTTTTGCCGTTATGTCAATCCAATCAGTTCTGTGATGCTGGGATTGCGTATGGTGAATCGGCGTGTGGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131016671
ATGGACTCTTCTCTTGCTCAAATAGCTCCTTCAGCCCATCTCCTCATCATCGTTTTCCTTTCACTCCTTTTGCCGTTATGTCAATCCAATCAGTTCTGTGATGCTGGGATTGCGTATGGTGAATCGGCGTGTGGAACTGCTACGGCGCCTACGTCGAAGATATTGATAAAGGGGGGAACTGTGGTGAATGCTCACCATAAAGAGGTTTCTGATGTATATATTGAGGATGGCATCATTGCTGCAGTACAGAAGAATATCGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057801366.1
MDSSLAQIAPSAHLLIIVFLSLLLPLCQSNQFCDAGIAYGESACGTATAPTSKILIKGGTVVNAHHKEVSDVYIEDGIIAAVQKNIVVADDVKIIDATGKYVMPGGIDPHTHLAMEFMGTETIDDFFSGQAAALAGGTTMHIDFVIPVNGGLSAGFEAYVKKAERSVMDYGFHMAITKWDDTVSREMEVMVKEKGINSFKFFMAYKGSLMISDELLLEGFKKCKSLGALAMVHAENGDAVFEGQKRMIELGITGPEGHAL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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