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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001320`

染色体: Chr01 坐标: 26228294-26230613 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001320`
名称	SmilChr01G001320
描述	L-ascorbate oxidase-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	26228294 - 26230613 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131017000`
GeneID	`131017000`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131017000`
原始查询	`SmilChr01G001320`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	L-ascorbate oxidase-like
产物	L-ascorbate oxidase-like
Arabidopsis	`AT5G21105` (AT5G21105) Plant L-ascorbate oxidase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832235] identity=60.4; qcov=0.995; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os06g0567200` (OsAAO1) - identity=60.5; qcov=0.996; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005507 (copper ion binding); GO:0005576 (extracellular region); GO:0009506 (plasmodesma); GO:0016491 (oxidoreductase activity)
KEGG	smil00053 (Ascorbate and aldarate metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00394 (Cu-oxidase); PF07731 (Cu-oxidase_2); PF07732 (Cu-oxidase_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131017000

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057801835.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057801835.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057801835.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057801835.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057801835.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:26228481`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr1:26228719`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B133,C61
`Chr1:26228748`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A14,B36,B8,C70
`Chr1:26228762`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	A4
`Chr1:26228762`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	A4
`Chr1:26229016`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A1,B3,B40,C19,C80
`Chr1:26229023`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B118
`Chr1:26229042`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B2,C37,D4
`Chr1:26229154`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B11
`Chr1:26229154`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B11
`Chr1:26229322`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A13,C59,C6
`Chr1:26229390`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B130,B51,B58,B97,C51

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057801835.1

569 aa

284

569

Cu-oxidase_3

Cu-oxidase

Cu-oxidase_2

PF07732 Cu-oxidase_3 29-144 aa PF00394 Cu-oxidase 157-319 aa PF07731 Cu-oxidase_2 427-546 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057801835.1`	Pfam	`PF07732`	Cu-oxidase_3	Domain	29	144	6.2e-40	136.7	Multicopper oxidase
`XP_057801835.1`	Pfam	`PF00394`	Cu-oxidase	Domain	157	319	1.8e-42	145.8	Multicopper oxidase
`XP_057801835.1`	Pfam	`PF07731`	Cu-oxidase_2	Domain	427	546	4.8e-36	124.2	Multicopper oxidase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057945852.1
GTTGCAACTCATGAGCCCTCAGCCATTTGTTTAGATATATAGAAAAGATGGTATCAGCATCAGCATGGTTGATTTTGATTTTGGTTTGGATGAGTAATAGTGTAAGGGCAGAGCAGAATTTGAGATGGGAGGTGGGATACATGCGGTGGTCTCCAGACGGGGTGGAAGATGTGATTATGACCATCAACGGCCACTACCCGGGCCCCACCATTCGGGCTGTGGCCGGCGAGACCATTCAGGTTCACCTCACCAACGGCCTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131017000
ATGGTATCAGCATCAGCATGGTTGATTTTGATTTTGGTTTGGATGAGTAATAGTGTAAGGGCAGAGCAGAATTTGAGATGGGAGGTGGGATACATGCGGTGGTCTCCAGACGGGGTGGAAGATGTGATTATGACCATCAACGGCCACTACCCGGGCCCCACCATTCGGGCTGTGGCCGGCGAGACCATTCAGGTTCACCTCACCAACGGCCTTCCCACAGAGGGAGTCGTCATCCACTGGCATGGAATCAGACAGATTGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057801835.1
MVSASAWLILILVWMSNSVRAEQNLRWEVGYMRWSPDGVEDVIMTINGHYPGPTIRAVAGETIQVHLTNGLPTEGVVIHWHGIRQIGTPWSDGTASISQCAINPGESFVYKFTVDRAGTYFYHGHFGMQRSAGLYGMLIVNSPQGQETLQYDAELDLLLSDWWHSSTRDQEVDLSSNPMIWIGEPQTLLMNGRGQFNCSLAANYGNSSLGPCNIKGGEQYAPYIFHVQPNNTYRLRIASSTSLSSLNLAIGNHNLTVVEA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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