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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001323`

染色体: Chr01 坐标: 26265224-26266468 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001323`
名称	SmilChr01G001323
描述	L-ascorbate oxidase-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	26265224 - 26266468 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131005217`
GeneID	`131005217`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131005217`
原始查询	`SmilChr01G001323`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	L-ascorbate oxidase-like
产物	L-ascorbate oxidase-like
Arabidopsis	`AT5G21105` (AT5G21105) Plant L-ascorbate oxidase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832235] identity=62.4; qcov=0.967; evalue=1.36e-108; confidence=high
Rice	`Os06g0567200` (OsAAO1) - identity=59.6; qcov=0.971; evalue=2.19e-92; confidence=high
GO	GO:0005507 (copper ion binding); GO:0009506 (plasmodesma); GO:0016491 (oxidoreductase activity)
KEGG	-
Pfam	PF07731 (Cu-oxidase_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131005217

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057788041.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057788041.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057788041.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057788041.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057788041.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:26265225`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	54	A10,A18,A20,A22,A23,B102,B103,B105,B107,B108,B112,B117,B121,B123,B128,B129,B132,B134,B18,B27,B29,B30,B34,B39,B42,B48,B53,B61,B63,B65,B66,B71,B76,B80,B85,B87,B98,C16,C24,C29,C39,C4,C42,C43,C47,C50,C56,C66,C68,C71,C73,D10,D3,D9
`Chr1:26265240`	`ACC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	108	A11,A16,A19,A20,A8,B100,B104,B105,B109,B111,B112,B113,B118,B119,B120,B125,B126,B128,B129,B13,B131,B134,B136,B137,B14,B15,B17,B2,B20,B21,B23,B25,B27,B30,B32,B34,B39,B4,B41,B42,B43,B44,B5,B50,B52,B55,B56,B57,B58,B6,B61,B63,B69,B7,B71,B73,B74,B75,B77,B78,B8,B84,B87,B88,B89,B9,B90,B95,B96,C1,C10,C11,C12,C17,C2,C20,C21,C22,C23,C24,C25,C29,C3,C41,C49,C5,C51,C52,C55,C56,C58,C59,C6,C60,C62,C64,C68,C7,C71,C73,C74,C75,C82,C83,C85,C9,D4,D7
`Chr1:26265253`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	10	A10,A23,B103,B107,B112,B53,B61,B66,B87,C39
`Chr1:26265802`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B23,C35,D2
`Chr1:26265804`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B113,B82
`Chr1:26265993`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B8
`Chr1:26266076`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A5,B122,B13,B75,C57
`Chr1:26266137`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B114,B119,B135,B16,B69
`Chr1:26266278`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B40

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057788041.1

242 aa

121

242

Cu-oxidase_2

PF07731 Cu-oxidase_2 88-218 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057788041.1`	Pfam	`PF07731`	Cu-oxidase_2	Domain	88	218	3e-37	128.1	Multicopper oxidase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057932058.1
ATGTATATGTGGTCCTACCATAGTTTTTGGCAAGGCCTTCTCCAACAAGATCCTCGCCGCCGCCGGATCCTCGCCGCCGCCGGATCCCCCATGCCGCCGCCCGCCCACGACAGGCGAATCGTGCTGCTGAACACGCAAAACACCATGGACGGGTTCACAAAGTGGTCCATCAACAACATCTCACTAGCCCACCCCAGCACCCCCTACTTGGGCGCCATCAAATACAACCTGGCTGACGCCTACGACCACACCAGCCCCCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131005217
ATGTATATGTGGTCCTACCATAGTTTTTGGCAAGGCCTTCTCCAACAAGATCCTCGCCGCCGCCGGATCCTCGCCGCCGCCGGATCCCCCATGCCGCCGCCCGCCCACGACAGGCGAATCGTGCTGCTGAACACGCAAAACACCATGGACGGGTTCACAAAGTGGTCCATCAACAACATCTCACTAGCCCACCCCAGCACCCCCTACTTGGGCGCCATCAAATACAACCTGGCTGACGCCTACGACCACACCAGCCCCCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057788041.1
MYMWSYHSFWQGLLQQDPRRRRILAAAGSPMPPPAHDRRIVLLNTQNTMDGFTKWSINNISLAHPSTPYLGAIKYNLADAYDHTSPPDHYTPADYDIRVPPPNPNTTSGNVIYELSFGSTVDVILQNANTNTFNVSEIHPWHLHGHDFWVLGYGEGKFTDKDEAGFNLKNPPLRNTAVIFPYGWTALRFVADNPGAWAFHCHIEPHLHLGMGVVFAEGVHRLGAIPNEALACGLTAKYLMNK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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