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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001604`

染色体: Chr01 坐标: 30200381-30204921 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001604`
名称	SmilChr01G001604
描述	cytochrome c oxidase assembly protein COX15-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	30200381 - 30204921 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019122`
GeneID	`131019122`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019122`
原始查询	`SmilChr01G001604`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	cytochrome c oxidase assembly protein COX15-like
产物	cytochrome c oxidase assembly protein COX15-like
Arabidopsis	`AT5G56090` (COX15) cytochrome c oxidase 15 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835708] identity=58.3; qcov=0.894; evalue=3.55e-145; confidence=high
Rice	`Os08g0496000` - identity=54.9; qcov=0.837; evalue=1.35e-134; confidence=high
GO	GO:0005743 (mitochondrial inner membrane); GO:0006784 (heme A biosynthetic process); GO:0016653 (oxidoreductase activity, acting on NAD(P)H, heme protein as acceptor)
KEGG	smil00190 (Oxidative phosphorylation - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00860 (Porphyrin metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01240 (Biosynthesis of cofactors - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF02628 (COX15-CtaA)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019122

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057803793.1`
2	Mitochondrion membrane	线粒体膜	1.00000	`XP_057803793.1`
3	Mitochondrion inner membrane	线粒体内膜	1.00000	`XP_057803793.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057803793.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803793.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:30200643`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A20,B36,B4,B54,B91
`Chr1:30200991`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B112,B24,C42,D4
`Chr1:30201026`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr1:30202370`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B82
`Chr1:30203552`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B29,C62

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803793.1

453 aa

226

453

COX15-CtaA

PF02628 COX15-CtaA 113-426 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803793.1`	Pfam	`PF02628`	COX15-CtaA	Family	113	426	4.8e-64	217.1	Cytochrome oxidase assembly protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947810.1
CCTCTTTCAATTTTGAAAACTTTCTAGCTCGGATCAATTCTTCTCTTACGCTACAATAACTATTTTGTAGATGAAGGGAGTATTTGTTTTTTAACATTCTTGACCACATTTTTGTGGCTTGGTGAATTGGGATAGAGAACTATGTGAATAAAGTATAATTCCACATATTCAGTGCGCAAATTGGTGTTTCACCATGATTGAAAACAAATTCATTTTGCTTCTGAGGAGAAGCAAATCCCTAACCCCCAAATTCTCTGCAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131019122
ATGATTGAAAACAAATTCATTTTGCTTCTGAGGAGAAGCAAATCCCTAACCCCCAAATTCTCTGCATCAAAGTTTAGCAAATGGAAACCATATTCTACTCCTTCAACCGAATCACAGTCAAGATTTTACTATTCGAGACTTATTCCTTCTGTCAAAACCTCAATCACAGGAAGCTTCATTGGCTGTGGTTTGAGGTCATTGCTTCAAAATAATGTTAAGAGCTTCCATATTAGCTCGTTCCGAAATTTCTCAACTGCGAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803793.1
MIENKFILLLRRSKSLTPKFSASKFSKWKPYSTPSTESQSRFYYSRLIPSVKTSITGSFIGCGLRSLLQNNVKSFHISSFRNFSTATSANAKGTKGLKLLVTAGSNAQEVVSIWLFVCAAWVYSMVVLGSVTRLTKSGLSMTDWKFTGRLPLSNDDWLVEFEKYQQSHEYKRVNKEMTLDDFRFMYYMEYAHVLWGRSLGVMFGVPFSYFLLKRYIPLRLGLRLSGLFALCAGQGLIGRWTSKSGSEEPKSEFAVPRVTF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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