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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001605`

染色体: Chr01 坐标: 30212030-30213779 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001605`
名称	SmilChr01G001605
描述	protein trichome birefringence-like 36
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	30212030 - 30213779 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019185`
GeneID	`131019185`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019185`
原始查询	`SmilChr01G001605`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein trichome birefringence-like 36
产物	protein trichome birefringence-like 36
Arabidopsis	`AT3G54260` (TBL36) TRICHOME BIREFRINGENCE-LIKE 36 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824593] identity=59.5; qcov=0.931; evalue=1.91e-164; confidence=high
Rice	`Os03g0290900` (OsTBL18) - identity=40.4; qcov=0.86; evalue=2.05e-92; confidence=medium
GO	GO:0005794 (Golgi apparatus); GO:0016413 (O-acetyltransferase activity)
KEGG	-
Pfam	PF13839 (PC-Esterase); PF14416 (PMR5N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019185

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057803850.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057803850.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803850.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803850.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057803850.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:30212067`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	4	A21,B131,B38,B39
`Chr1:30212067`	`C`	`CA`	1bp_insertion	CDS_variant	4	A21,B131,B38,B39
`Chr1:30212087`	`AAC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	9	A1,A2,B103,B106,B139,B49,C21,C44,D10
`Chr1:30212110`	`A`	`ACT`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	C74
`Chr1:30212110`	`A`	`ACT`	2bp_insertion	CDS_variant	1	C74
`Chr1:30212289`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C49
`Chr1:30212403`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr1:30212591`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B78,C16
`Chr1:30212666`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C15,D9
`Chr1:30212699`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B136,C11,C69
`Chr1:30212843`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C6
`Chr1:30212903`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	27	A14,A19,A22,B102,B133,B19,B26,B27,B32,B36,B45,B5,B58,B67,B70,B80,B81,C1,C17,C32,C37,C40,C6,C62,C65,C70,D6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803850.1

406 aa

203

406

PMR5N

PC-Esterase

PF14416 PMR5N 83-134 aa PF13839 PC-Esterase 135-405 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803850.1`	Pfam	`PF14416`	PMR5N	Domain	83	134	4.3e-22	78.9	PMR5 N terminal Domain
`XP_057803850.1`	Pfam	`PF13839`	PC-Esterase	Family	135	405	1.6e-86	291.5	GDSL/SGNH-like Acyl-Esterase family found in Pmr5 and Cas1p

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947867.1
GCAAGTCAAGCCAAGATTAAAGTTGCACAAATCATGTCAAACTTTTTCAAACATATAAACACTCACTCACTCACTCACTCACACATTGTTGACACCAAAGGTTTCCTCTGTCTGAAAATGGCAGACTTCCAAACCAGTAGTAAGCCTTTGCTTCTCTCACTCTTCTTCGTCTGCTTCTCTCTCATCCACTCATCCAAGTATGACCATGAAGAGCTGCAGTGGCTAGACGACAAAGACGATGAGATCTCCATGTTCGAGAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131019185
ATGTCAAACTTTTTCAAACATATAAACACTCACTCACTCACTCACTCACACATTGTTGACACCAAAGGTTTCCTCTGTCTGAAAATGGCAGACTTCCAAACCAGTAGTAAGCCTTTGCTTCTCTCACTCTTCTTCGTCTGCTTCTCTCTCATCCACTCATCCAAGTATGACCATGAAGAGCTGCAGTGGCTAGACGACAAAGACGATGAGATCTCCATGTTCGAGAGCAGGCATTCATCCCTCAGAAGCTGTGACTTGAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803850.1
MSNFFKHINTHSLTHSHIVDTKGFLCLKMADFQTSSKPLLLSLFFVCFSLIHSSKYDHEELQWLDDKDDEISMFESRHSSLRSCDLSKGKWVYDQTYPLYDANCPYLSSAVACRKNGRPDSDYEKWRWKPDGCSIPRFDALEFLGRMRRKRIMLVGDSIMRNQWESLVCLLQSVVPTPRKTVIYNGPTMAFLALDFEMSIEFCWAPFLVELKREADGKRILHLDLIEENAKYWRGVDTLVFDSAHWWTHSDKWSSWDFVM...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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