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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001626`

染色体: Chr01 坐标: 30334013-30335152 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001626`
名称	SmilChr01G001626
描述	uncharacterized SmilChr01G001626
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	30334013 - 30335152 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019389`
GeneID	`131019389`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019389`
原始查询	`SmilChr01G001626`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Integral membrane Yip1 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824442]; symbol=AT3G52760; hit=AT3G52760; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Integral membrane Yip1 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824442]; symbol=AT3G52760; hit=AT3G52760; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT3G52760` (AT3G52760) Integral membrane Yip1 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824442] identity=59.5; qcov=1.04; evalue=4.31e-104; confidence=high
Rice	`Os03g0289200` - identity=60.1; qcov=1.07; evalue=2.17e-90; confidence=high
GO	GO:0005802 (trans-Golgi network); GO:0006888 (endoplasmic reticulum to Golgi vesicle-mediated transport); GO:0016020 (membrane); GO:0048280 (vesicle fusion with Golgi apparatus)
KEGG	-
Pfam	PF04893 (Yip1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019389

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057803918.1`
2	Endoplasmic reticulum	内质网	0.60000	`XP_057803918.1`
3	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.60000	`XP_057803918.1`
4	Cis-golgi network	Cis-golgi network	0.40000	`XP_057803918.1`
5	Vesicle	囊泡	0.40000	`XP_057803918.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:30334540`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B139
`Chr1:30334546`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B112,B88
`Chr1:30334780`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B114,B64,C60,D4
`Chr1:30334792`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A19,C43
`Chr1:30334798`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B136,C11,C69
`Chr1:30334821`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D1
`Chr1:30334822`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D1
`Chr1:30334829`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D1
`Chr1:30334870`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	5	A21,A6,B29,B57,C76
`Chr1:30334870`	`G`	`GT`	1bp_insertion	CDS_variant	5	A21,A6,B29,B57,C76
`Chr1:30334878`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D1
`Chr1:30334888`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C76,D1

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803918.1

251 aa

126

251

Yip1

PF04893 Yip1 103-250 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803918.1`	Pfam	`PF04893`	Yip1	Domain	103	250	7.5e-12	46.2	Yip1 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947935.1
TTAATTCTGCGCTTACGAAAAAAACCCTAATTTCCCCTTATTTACATTTGTGTCCACGACCTGGAAGAATCATCCTACACTTCTTCACCACGAAAGAGCCAAAATTAATCAAAAGCGTTTCTCGCCAGATCTCCAATCCCGATCCATGGCAAAGGAATTCAACGTGCCCCCGGTGGTTTTTCCCTCCGGCGGGAATCCGGCGACGGCCGCCTCCGGCCCCCAGCAGCGCCGCCTCCCTACCGCTCCTTTCCAGCCCCCGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131019389
ATGGCAAAGGAATTCAACGTGCCCCCGGTGGTTTTTCCCTCCGGCGGGAATCCGGCGACGGCCGCCTCCGGCCCCCAGCAGCGCCGCCTCCCTACCGCTCCTTTCCAGCCCCCGAGATCCTCGAACCCTGGCCTCCCCTTCCTCTCCTTCGATGTCAACTCCGCCGCCGCGTCCACCTCCTTCTCCGCCGCGCCTCAATTCCCCTCCACGATCGGCGGCGTCGGTGGCAGCTTCGACGACGAGCCGCCGCTTCTCGAAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803918.1
MAKEFNVPPVVFPSGGNPATAASGPQQRRLPTAPFQPPRSSNPGLPFLSFDVNSAAASTSFSAAPQFPSTIGGVGGSFDDEPPLLEELGINTKQIYQKTLSILNPFRINHYLHEDADLSGPFLFLMAFGLFQLLAGKLHFGIILGWVTMASMFLYVVFNMLAGKNGNLDMYKCLSLIGYCMLPIVMLSAVSLFLPQGGMAIMVITGLFVIWSTRVCTGLVVELANCGDEHRGLIAYACFLIYMLFSLLVIF

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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