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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001682`

染色体: Chr01 坐标: 31013291-31016406 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001682`
名称	SmilChr01G001682
描述	superoxide dismutase [Cu-Zn], chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	31013291 - 31016406 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019991`
GeneID	`131019991`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019991`
原始查询	`SmilChr01G001682`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	superoxide dismutase [Cu-Zn], chloroplastic
产物	superoxide dismutase [Cu-Zn]%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT2G28190` (CSD2) copper/zinc superoxide dismutase 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817365] identity=71.5; qcov=0.982; evalue=1.71e-103; confidence=high
Rice	`Os08g0561700` (OsSOD4) - identity=76.9; qcov=0.924; evalue=2.05e-99; confidence=high
GO	GO:0004784 (superoxide dismutase activity); GO:0005507 (copper ion binding); GO:0019430 (removal of superoxide radicals)
KEGG	smil04146 (Peroxisome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00080 (Sod_Cu)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019991

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057804613.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057804613.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057804613.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057804613.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057804613.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:31013446`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C48
`Chr1:31013467`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A6,B137,B79,B8,D1
`Chr1:31013518`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B88
`Chr1:31013545`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C13
`Chr1:31013578`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:31014340`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	37	A2,A24,A25,A3,A6,B1,B10,B105,B107,B110,B120,B133,B16,B18,B19,B36,B44,B5,B54,B6,B72,B75,B87,B9,B94,C10,C16,C18,C24,C29,C30,C36,C37,C55,C62,C65,D3

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804613.1

225 aa

112

225

Sod_Cu

PF00080 Sod_Cu 86-220 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804613.1`	Pfam	`PF00080`	Sod_Cu	Domain	86	220	1.1e-48	165.7	Copper/zinc superoxide dismutase (SODC)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948630.1
AATGACAAACGAAGAGACGAGAAAACACTGGATTGACTCTTCGCCCACTCACACTCTATCATCTGATCCAATCCTATGCAGGCAGCTCTCGCAGTCATGGCCGCACACTCTGTTCTCGCCGCCGTCGCTGCCGGCCACCAACCTCTCCTCTTCCCCACCATTTCGTCTACCTCTTCGCCGTCGGTCCATTTCCATTCCTCCTTTCATGGCGTCGCTCTTAAGGCCAAGGTCCGCCCATTTCTATCTCTCTCCGCCGCCGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131019991
ATGCAGGCAGCTCTCGCAGTCATGGCCGCACACTCTGTTCTCGCCGCCGTCGCTGCCGGCCACCAACCTCTCCTCTTCCCCACCATTTCGTCTACCTCTTCGCCGTCGGTCCATTTCCATTCCTCCTTTCATGGCGTCGCTCTTAAGGCCAAGGTCCGCCCATTTCTATCTCTCTCCGCCGCCGCCGCCCCCAAGCCTCTCGCCGTAGTCTCCGCCGCCAAGAAGGCTGTTGCCGTCCTCAAAGGGACTGCCGGTGTCGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057804613.1
MQAALAVMAAHSVLAAVAAGHQPLLFPTISSTSSPSVHFHSSFHGVALKAKVRPFLSLSAAAAPKPLAVVSAAKKAVAVLKGTAGVEGVVTLTQDGDGPTTVNVRVTGLAPGKHGFHLHEFGDTTNGCISTGPHFNPNGLTHGAPEDEVRHAGDLGNIIANAEGVAEATIVDPQIPLSGPNAVVGRAFVVHELEDDLGKGGHELSLSTGNAGGRLACGVVGLTPL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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