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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001727`

染色体: Chr01 坐标: 31817111-31822515 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001727`
名称	SmilChr01G001727
描述	glucomannan 4-beta-mannosyltransferase 2-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	31817111 - 31822515 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020366`
GeneID	`131020366`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020366`
原始查询	`SmilChr01G001727`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	glucomannan 4-beta-mannosyltransferase 2-like
产物	glucomannan 4-beta-mannosyltransferase 2-like
Arabidopsis	`AT5G22740` (CSLA02) cellulose synthase-like A02 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832337] identity=75.8; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os06g0625700` (OsCslA9) - identity=69.1; qcov=0.972; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005794 (Golgi apparatus); GO:0051753 (mannan synthase activity)
KEGG	-
Pfam	PF00535 (Glycos_transf_2); PF13632 (Glyco_trans_2_3); PF13641 (Glyco_tranf_2_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020366

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	0.40000	`XP_057805117.1`
2	Golgi apparatus	高尔基体	0.40000	`XP_057805117.1`
3	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057805117.1`
4	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.20000	`XP_057805117.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057805117.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:31817870`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C61
`Chr1:31817906`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B100,B47,D7
`Chr1:31817969`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B120,B77,C46
`Chr1:31818044`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B129,B38,B39,C49,C77
`Chr1:31818053`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B129,B38,B39,C49,C77
`Chr1:31819007`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B45,C25,C34,C72,D8
`Chr1:31821227`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C67
`Chr1:31821747`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A23
`Chr1:31822105`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B91,C57

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805117.1

533 aa

266

533

Glyco_tranf_2_3

Glycos_transf_2

Glyco_trans_2_3

PF13641 Glyco_tranf_2_3 99-332 aa PF00535 Glycos_transf_2 102-261 aa PF13632 Glyco_trans_2_3 190-394 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805117.1`	Pfam	`PF13641`	Glyco_tranf_2_3	Domain	99	332	1.6e-15	58.2	Glycosyltransferase like family 2
`XP_057805117.1`	Pfam	`PF00535`	Glycos_transf_2	Domain	102	261	1.3e-09	38.9	Glycosyl transferase family 2
`XP_057805117.1`	Pfam	`PF13632`	Glyco_trans_2_3	Domain	190	394	3.3e-22	80.0	Glycosyl transferase family group 2

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949134.1
AAATTTAACTTATATCAACCATGAAACATGCCAAAAGCCCCCACTCAAACTTACATGTTATTCCAATTCATCAATCTACAATCATAGAAATGCCACCTTCTTGGATCACACCATCTTTTGGCATGGCATAGCACCCATAAGCTATCAAACACCACATCACATTTTCCCATTTTTGATTAATCATTAAAAAAAAATCAATTTTATAGTAAAATAATATACTACTACATACCCTAAACTCATTTTTGTTACATTTATCTTTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020366
ATGGCGGAGATATCGGGTAAAAATTTCATACCGGAATCGTTTCAAGGGTACACGCCGGACATCGCGGGGCAAATCGGCCTACTGTGGGAGCTAATCAAGGCGCCATTGATAGTCCCCTTGCTCACCATCTGCGTCTACATTTGCTTGGCTATGTCGATAATGGTGTTCATGGAGAGGCTCTACATGGGCGTCGTCATCATCCTGGTCAAGCTCTTCTGGAGGAAGCCGGAGAAGCGCTACAAATTCGAGCCCATGAAAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057805117.1
MAEISGKNFIPESFQGYTPDIAGQIGLLWELIKAPLIVPLLTICVYICLAMSIMVFMERLYMGVVIILVKLFWRKPEKRYKFEPMKDDLESGNATYPLVLVQIPMFNEKEVYKISIGAACNLSWPADRLVIQVLDDSTDLVVKDMVERECIRWASKGINIRYQIRESRGGYKAGALKEGLKRDYVKACEYVVIFDADFRPDPDFLRRSVPFLIHNPDIALVQARWRFVNSNECLLTRMQEMSLDYHFKVEQEVGSATHAF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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