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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001772`

染色体: Chr01 坐标: 32630790-32635544 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001772`
名称	SmilChr01G001772
描述	uncharacterized SmilChr01G001772
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	32630790 - 32635544 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020282`
GeneID	`131020282`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020282`
原始查询	`SmilChr01G001772`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Methylthiotransferase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843540]; symbol=AT1G72090; hit=AT1G72090; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Methylthiotransferase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843540]; symbol=AT1G72090; hit=AT1G72090; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G72090` (AT1G72090) Methylthiotransferase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843540] identity=67.2; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os04g0434300` - identity=66.6; qcov=0.979; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005783 (endoplasmic reticulum); GO:0035598 (tRNA (N(6)-L-threonylcarbamoyladenosine(37)-C(2))-methylthiotransferase activity); GO:0035600 (tRNA methylthiolation); GO:0051539 (4 iron, 4 sulfur cluster binding)
KEGG	-
Pfam	PF00919 (UPF0004); PF01938 (TRAM); PF04055 (Radical_SAM)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020282

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	0.40000	`XP_057804987.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057804987.1`
3	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057804987.1`
4	Chloroplast membrane	叶绿体膜	0.20000	`XP_057804987.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057804987.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:32630913`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B111,B60,C37
`Chr1:32631022`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C12
`Chr1:32631277`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A18
`Chr1:32633149`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C12
`Chr1:32633295`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B118,B124,C20,C70

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804987.1

618 aa

309

618

UPF0004

Radical_SAM

TRAM

PF00919 UPF0004 58-136 aa PF04055 Radical_SAM 195-368 aa PF01938 TRAM 420-479 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804987.1`	Pfam	`PF00919`	UPF0004	Family	58	136	1.5e-21	76.9	Uncharacterized protein family UPF0004
`XP_057804987.1`	Pfam	`PF04055`	Radical_SAM	Domain	195	368	2e-19	71.1	Radical SAM superfamily
`XP_057804987.1`	Pfam	`PF01938`	TRAM	Domain	420	479	1.7e-05	25.3	TRAM domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949004.1
AAAACATGTCTTCCGATTCTCCTCCAACACTAACTCACAGCACCTAATGGAAGACATAGAGGATTTGCTGGTCGGAGGCGGCGGCGGAGTGCCGCCGGGGTTCCGGCTACCGGTGGCGGCGGCGGTGGGAGTCAAGCCTAGGTCTAAATCCAGGGGTACCGTATTTCACGACTCGCTGAAGAGCAATAGTTCTGCCAAAATCCCAGGCACTCAGACAATCTACTTGAAAACTTTTGGATGTTCGCATAATCAGAGTGATA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020282
ATGGAAGACATAGAGGATTTGCTGGTCGGAGGCGGCGGCGGAGTGCCGCCGGGGTTCCGGCTACCGGTGGCGGCGGCGGTGGGAGTCAAGCCTAGGTCTAAATCCAGGGGTACCGTATTTCACGACTCGCTGAAGAGCAATAGTTCTGCCAAAATCCCAGGCACTCAGACAATCTACTTGAAAACTTTTGGATGTTCGCATAATCAGAGTGATAGTGAATATATGGCGGGTCAGCTTTCTGCATTTGGGTATAATTTGAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057804987.1
MEDIEDLLVGGGGGVPPGFRLPVAAAVGVKPRSKSRGTVFHDSLKSNSSAKIPGTQTIYLKTFGCSHNQSDSEYMAGQLSAFGYNLSENQDEADLWLINTCTVKAPSQSAMETLIAKCRSAQKPLVVAGCVPQGSRDLKELEGVSIVGVQQIDRVVEVVEETLKGYEVRLLTRKTLPALDLPKVRKNKFVEILPINVGCLGACTYCKTKHARGHLGSYTVDSLAGRVRAVVADGVKEIWLSSEDTGAYGRDIGVNLPILL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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