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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001783`

染色体: Chr01 坐标: 32699486-32703096 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001783`
名称	SmilChr01G001783
描述	probable alkaline/neutral invertase D
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	32699486 - 32703096 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020312`
GeneID	`131020312`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020312`
原始查询	`SmilChr01G001783`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable alkaline/neutral invertase D
产物	probable alkaline/neutral invertase D
Arabidopsis	`AT4G09510` (CINV2) cytosolic invertase 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826535] identity=83.5; qcov=0.981; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0550600` (OsNIN8) - identity=80.3; qcov=0.97; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004575 (sucrose alpha-glucosidase activity); GO:0005987 (sucrose catabolic process); GO:0033926 (endo-alpha-N-acetylgalactosaminidase activity)
KEGG	smil00052 (Galactose metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00500 (Starch and sucrose metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF12899 (Glyco_hydro_100)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020312

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057805033.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057805033.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057805033.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057805033.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057805033.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:32699753`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B4,C36
`Chr1:32699755`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A20,B104,B18,B49,C25
`Chr1:32699932`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A7
`Chr1:32699965`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B7,C45
`Chr1:32699992`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B78
`Chr1:32700004`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A16,B11
`Chr1:32700396`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B64,C9,D7
`Chr1:32700401`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C16,C61,C86
`Chr1:32700591`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35
`Chr1:32700654`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr1:32700663`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A23
`Chr1:32700720`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A16,B11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805033.1

570 aa

285

570

Glyco_hydro_100

PF12899 Glyco_hydro_100 108-544 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805033.1`	Pfam	`PF12899`	Glyco_hydro_100	Repeat	108	544	1.2e-218	726.8	Alkaline and neutral invertase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949050.1
GTGTAATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCGTTGGTATATAAACTGAAGCTTCTGCAATCATGCACATTTTTTCCCTTTCTTCTCTGTTTGTACGTTTTGATCGTTGGTATAATGCTCCTGCAATCTCTCTCACCGTCTCTCTAGCTGGAAACTATCTCCCTATATTCCCTCTTTCCGTTGATTATTTCTTTCATTCCGACATTTCCAAATGCCTTGAAGAGGGAAACTTGTGTTGAGGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020312
ATGGATGGTGCTAAGGCCAATGTGGATGGTACGAGGGGTGGAATGCGCGATGGTGGGAAACGGAGTGGTCTTAGCAATGTCAGCTCTCATTGCTCGCTCTCTGAAATGGATGGCTATGATATGTCCAAGTTAAGGACTAAGTCGAAATTGAACATAGAGAGGCAGAGATCTTTTGATGAGAGGTCACTTAGTGAGTTAACAAGTGGTTTGAACAGATGTTTGGAAGGTTATGAGTGTGCTTATTCACCCGGACGAGCATC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057805033.1
MDGAKANVDGTRGGMRDGGKRSGLSNVSSHCSLSEMDGYDMSKLRTKSKLNIERQRSFDERSLSELTSGLNRCLEGYECAYSPGRASLYSPVSCGWNSFEPHPIVGDAWESLRRSLVYFRGQPVGTIAAYDHASEEVLNYDQVFVRDFVPSALAFLMNGEPDIVKNFLLKTLQLQGWEKRIDRFKLGEGAMPASFKVLHDPVRKTDTIAADFGESAIGRVAPVDSGFWWIILLRAYTKSTGDMSLAETPDCQRGMKLILT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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