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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001835`

染色体: Chr01 坐标: 33283408-33287189 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001835`
名称	SmilChr01G001835
描述	protein SUPPRESSOR OF K(+) TRANSPORT GROWTH DEFECT 1
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	33283408 - 33287189 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021112`
GeneID	`131021112`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021112`
原始查询	`SmilChr01G001835`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein SUPPRESSOR OF K(+) TRANSPORT GROWTH DEFECT 1
产物	protein SUPPRESSOR OF K(+) TRANSPORT GROWTH DEFECT 1
Arabidopsis	`AT2G27600` (SKD1) AAA-type ATPase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817306] identity=88.5; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0159900` - identity=74.7; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005524 (ATP binding); GO:0007033 (vacuole organization); GO:0016197 (endosomal transport); GO:0016887 (ATP hydrolysis activity)
KEGG	smil03250 (Viral life cycle - HIV-1 - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil03272 (Virion - Hepatitis viruses - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04144 (Endocytosis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00004 (AAA); PF04212 (MIT); PF07728 (AAA_5); PF09336 (Vps4_C); PF17862 (AAA_lid_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021112

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057806188.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057806188.1`
3	Cytoskeleton	细胞骨架	0.80000	`XP_057806188.1`
4	Midbody	Midbody	0.80000	`XP_057806188.1`
5	Spindle	Spindle	0.60000	`XP_057806188.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:33285496`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B29
`Chr1:33286690`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A11,C38
`Chr1:33286834`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B120,B35,B95,C34

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057806188.1

433 aa

216

433

MIT

AAA_5

AAA

AAA_lid_3

Vps4_C

PF04212 MIT 7-70 aa PF07728 AAA_5 166-288 aa PF00004 AAA 167-296 aa PF17862 AAA_lid_3 321-354 aa PF09336 Vps4_C 366-430 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057806188.1`	Pfam	`PF04212`	MIT	Domain	7	70	7.1e-21	74.8	MIT (microtubule interacting and transport) domain
`XP_057806188.1`	Pfam	`PF07728`	AAA_5	Domain	166	288	1e-05	26.3	AAA domain (dynein-related subfamily)
`XP_057806188.1`	Pfam	`PF00004`	AAA	Domain	167	296	3.2e-44	151.3	ATPase family associated with various cellular activities (AAA)
`XP_057806188.1`	Pfam	`PF17862`	AAA_lid_3	Domain	321	354	4.7e-08	33.1	AAA+ lid domain
`XP_057806188.1`	Pfam	`PF09336`	Vps4_C	Domain	366	430	2.6e-22	79.3	Vps4 C terminal oligomerisation domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057950205.1
TTTCATTTTGAAGTCAACAGGCGTGTAATTCTCGCAGCCAAGCCATTCCCCCTAACCCCAAAATCTCCCAAACTTCAATCCAAGGAAACCCCAATTTTTTAATTTTCCAATTCTTCATCATTTTCCGATTCAGCGCCCCAAAATCCCACGCGAAATCGAGCTGAATCGACCAATCCGACCTCCGGAAGAAGCTCAATTATTTATGATCGGCGACGATGTATAGCAATTTCAAGGAGCAAGCGATCGAGTACGTACGGCAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131021112
ATGTATAGCAATTTCAAGGAGCAAGCGATCGAGTACGTACGGCAGGCCGTCGCCGAGGACAACGCCGGAAACTATGCCAAGGCCTTCCCGCTCTACATGAACGCGCTAGAGTATTTCAGGACGCACCTCAAGTACGAGAAGAACCCTAAGATCAAGGAGGCGATCACGCAGAAGTTCACCGAGTACTTGCGCCGGGCCGAGGAGATCCGTGCCGTGCTCGACGAAGGAGGATCGGGCCCCGCCGCCAACGGGGACGCGGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057806188.1
MYSNFKEQAIEYVRQAVAEDNAGNYAKAFPLYMNALEYFRTHLKYEKNPKIKEAITQKFTEYLRRAEEIRAVLDEGGSGPAANGDAAVATRPKTKPKDGKDGEGEDGDKEKLRAGLNSAIVREKPNVKWNDVAGLESAKQALQEAVILPVKFPQFFTGKRRPWRAFLLYGPPGTGKSYLAKAVATEADSTFFSVSSSDLVSKWMGESEKLVSNLFQMARESSPSIIFIDEIDSLCGTRGEGNESEASRRIKTELLVQMQG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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