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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001840`

染色体: Chr01 坐标: 33337817-33339255 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001840`
名称	SmilChr01G001840
描述	protein CENTRORADIALIS-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	33337817 - 33339255 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021158`
GeneID	`131021158`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021158`
原始查询	`SmilChr01G001840`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein CENTRORADIALIS-like
产物	protein CENTRORADIALIS-like
Arabidopsis	`AT2G27550` (ATC) centroradiali [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817302] identity=77.8; qcov=0.994; evalue=6.01e-100; confidence=high
Rice	`Os04g0411400` (Rcn4) - identity=76; qcov=0.971; evalue=3.47e-99; confidence=high
GO	GO:0005634 (nucleus); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0009910 (negative regulation of flower development); GO:0010228 (vegetative to reproductive phase transition of meristem)
KEGG	-
Pfam	PF01161 (PBP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021158

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057806234.1`
2	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057806234.1`
3	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.20000	`XP_057806234.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057806234.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057806234.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:33338073`	`C`	`CG`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B114,D10
`Chr1:33338073`	`C`	`CG`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B114,D10
`Chr1:33338115`	`TAA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	113	A10,A11,A13,A14,A16,A20,A21,A23,A24,A5,A6,A9,B1,B10,B103,B105,B107,B109,B111,B112,B113,B117,B118,B119,B12,B123,B131,B137,B140,B18,B20,B22,B24,B26,B27,B28,B3,B33,B34,B35,B36,B38,B39,B40,B41,B42,B44,B46,B50,B53,B58,B65,B69,B7,B71,B74,B80,B82,B88,B90,B91,B93,B94,B95,B97,B98,C11,C12,C15,C16,C17,C18,C21,C22,C23,C27,C29,C3,C30,C35,C37,C38,C40,C43,C44,C45,C48,C5,C50,C51,C53,C58,C6,C60,C61,C62,C64,C65,C66,C67,C68,C69,C72,C74,C77,C78,C79,C80,C81,C85,C87,C9,D10
`Chr1:33338120`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	112	A10,A11,A13,A14,A16,A20,A21,A23,A24,A5,A6,A9,B1,B10,B103,B105,B107,B111,B112,B113,B117,B118,B119,B12,B123,B131,B137,B140,B18,B20,B22,B24,B26,B27,B28,B33,B34,B35,B36,B38,B39,B40,B41,B42,B44,B46,B50,B53,B58,B65,B69,B7,B71,B74,B80,B82,B85,B88,B90,B91,B93,B94,B95,B97,B98,C11,C12,C15,C16,C17,C18,C21,C22,C23,C27,C3,C30,C35,C37,C38,C40,C43,C44,C45,C46,C48,C5,C50,C51,C53,C58,C6,C60,C61,C62,C64,C65,C66,C67,C68,C69,C72,C74,C77,C78,C79,C80,C81,C85,C87,C9,D10
`Chr1:33338130`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	84	A11,A13,A21,A22,A23,A24,A5,A9,B103,B105,B111,B112,B113,B117,B118,B119,B12,B131,B137,B139,B22,B24,B26,B27,B28,B33,B34,B35,B36,B38,B39,B40,B41,B44,B46,B50,B53,B58,B65,B69,B71,B80,B85,B88,B90,B94,B95,B97,B98,C15,C16,C18,C21,C22,C23,C27,C3,C35,C37,C38,C40,C43,C44,C45,C46,C48,C5,C50,C53,C58,C6,C60,C64,C65,C66,C67,C68,C77,C78,C79,C80,C85,C87,D10
`Chr1:33338133`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	79	A11,A13,A21,A22,A23,A24,A5,A9,B103,B105,B111,B112,B113,B114,B117,B118,B119,B12,B131,B137,B139,B22,B24,B27,B28,B33,B34,B35,B36,B38,B40,B41,B44,B46,B50,B53,B58,B69,B71,B80,B85,B88,B90,B95,B97,B98,C15,C18,C21,C22,C23,C27,C3,C35,C37,C38,C43,C44,C45,C46,C48,C5,C50,C53,C58,C6,C60,C64,C65,C66,C67,C68,C77,C78,C79,C80,C85,C87,D10
`Chr1:33338175`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	78	A11,A13,A21,A22,A23,A24,A5,A9,B103,B105,B109,B111,B112,B117,B118,B119,B12,B131,B137,B138,B139,B17,B22,B24,B26,B28,B33,B34,B36,B38,B40,B41,B44,B46,B50,B53,B58,B66,B69,B71,B82,B88,B90,B94,B95,B97,C13,C15,C18,C21,C22,C23,C29,C3,C30,C35,C38,C40,C43,C45,C48,C50,C53,C6,C60,C64,C65,C66,C68,C77,C79,C8,C80,C87,D10,D3,D5,D9
`Chr1:33338180`	`C`	`CTT`	2bp_insertion	frameshift_variant	76	A11,A13,A14,A21,A22,A23,A24,A5,A9,B103,B105,B111,B112,B117,B118,B119,B12,B131,B137,B138,B139,B17,B22,B24,B26,B28,B33,B34,B36,B38,B41,B44,B46,B50,B53,B55,B58,B66,B69,B71,B82,B88,B90,B94,B95,B97,C13,C15,C18,C22,C23,C29,C3,C35,C38,C40,C43,C45,C48,C50,C53,C6,C60,C64,C65,C66,C68,C77,C79,C8,C80,C87,D10,D3,D5,D9
`Chr1:33338204`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	4	A23,B40,B66,C13
`Chr1:33338204`	`T`	`TC`	1bp_insertion	CDS_variant	4	A23,B40,B66,C13
`Chr1:33338211`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A23,B40,C13
`Chr1:33339056`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B103,C14,C56,C83

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057806234.1

172 aa

172

PBP

PF01161 PBP 51-160 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057806234.1`	Pfam	`PF01161`	PBP	Domain	51	160	1.5e-14	55.3	Phosphatidylethanolamine-binding protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057950251.1
TTTTTCTTTATTCCTTAAAACCCCAATTTATTTTAAAATTCTAAAATAGAGTAATACAGCTAGCCAGTGAGTCTTTGTTCAGTAATGTGATAGTTGTTATTGCCACTATAAATACATGGGGTTTGCTATTCCATTCTCAGCAGCACTATAAATATACACAATACATATATATATCGAAAATATGTCGTCGACGACGCCACTGATAATCGGAAGAGTGATCGGAGATGTGGTGGATAACTTCTCGGCGACGGTGAAAATGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131021158
ATGTCGTCGACGACGCCACTGATAATCGGAAGAGTGATCGGAGATGTGGTGGATAACTTCTCGGCGACGGTGAAAATGTCGGTGACGTACAACTCCAACAAGCATGTGTACAATGGGCACGAGCTCTTCCCTTCCCTAGTCGCCTCCAAACCTAGGGTTGAGGTTCATGGTGGCGATATGAGATCATTCTTCACCCTCATCATGACAGACCCTGATGTTCCTGGTCCTAGTGATCCCTATCTCAGGGAACACCTGCACTG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057806234.1
MSSTTPLIIGRVIGDVVDNFSATVKMSVTYNSNKHVYNGHELFPSLVASKPRVEVHGGDMRSFFTLIMTDPDVPGPSDPYLREHLHWIVTDIPGTTDSSFGKEVVSYEMPRPNIGIHRFVFLLFKQKKRDGIKAPVCKDGFNTRKFAEDNELGLPVAAVFFNCQRETANRRR

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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