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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001854`

染色体: Chr01 坐标: 33471818-33474480 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001854`
名称	SmilChr01G001854
描述	DNA polymerase II subunit B4-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	33471818 - 33474480 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021291`
GeneID	`131021291`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021291`
原始查询	`SmilChr01G001854`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	DNA polymerase II subunit B4-like
产物	DNA polymerase II subunit B4-like
Arabidopsis	`AT2G27470` (NF-YB11) nuclear factor Y, subunit B11 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817292] identity=60.8; qcov=0.622; evalue=1.5e-35; confidence=medium
Rice	`Os09g0568200` (OsHAP3L) - identity=53.8; qcov=0.846; evalue=1.19e-44; confidence=medium
GO	GO:0006272 (leading strand elongation); GO:0006974 (DNA damage response); GO:0008622 (epsilon DNA polymerase complex); GO:0008623 (CHRAC); GO:0031490 (chromatin DNA binding); GO:0031507 (heterochromatin formation); GO:0046982 (protein heterodimerization activity)
KEGG	smil03030 (DNA replication - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil03082 (ATP-dependent chromatin remodeling - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil03410 (Base excision repair - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil03420 (Nucleotide excision repair - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00808 (CBFD_NFYB_HMF)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021291

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057806403.1`
2	Chromosome	染色体	0.20000	`XP_057806403.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057806403.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057806403.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057806403.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:33472035`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B29,B41
`Chr1:33473149`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B91,C55
`Chr1:33474146`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C49,C55

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057806403.1

156 aa

156

CBFD_NFYB_HMF

PF00808 CBFD_NFYB_HMF 18-88 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057806403.1`	Pfam	`PF00808`	CBFD_NFYB_HMF	Domain	18	88	7.9e-08	33.2	Histone-like transcription factor (CBF/NF-Y) and archaeal histone

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057950420.1
ATCTAAAAACAGCAGCTAAAGATGGGCTAAATATATTTGAGACGGGCCTTCCTAAACTATCTACACATACAGTCTGGATGGCGGGAAAATAAAAACCTGCAACAATTGCAATTAGCGCACTCGCCATCGTCCACCGCAAATAGAATCAAAGCGCTGTCGTTTGAGAGATGTCGGAAGAGAAGAAAGATGATGAGGCGACGGAGAATGTGGTTGCGGAAGCGGAGCTGCCGAAGACTATCGTGCGCCGGGTGGTAAAGGAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131021291
ATGTCGGAAGAGAAGAAAGATGATGAGGCGACGGAGAATGTGGTTGCGGAAGCGGAGCTGCCGAAGACTATCGTGCGCCGGGTGGTAAAGGACAAGCTTTCCCAGCTCTCCACCGGCTCCGAGATTCCCGTGCTCCGCGACTCGCTCATTGCCTTCTCTGAGAGCGCCCGCATCTTCATCCACTACCTGTCCGCTACGGCAAATGACATATGTAAGGAGTCGAACAGACAAATAATTAATGCAGAAGATGTATTCAAGGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057806403.1
MSEEKKDDEATENVVAEAELPKTIVRRVVKDKLSQLSTGSEIPVLRDSLIAFSESARIFIHYLSATANDICKESNRQIINAEDVFKALEEIEFPEFIGPLRDSLEEFRQRNAGKKQSKAKQTNTKAKRKEPPPPEPNEGQNKRQASEAVASAPLED

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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