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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001887`

染色体: Chr01 坐标: 33975491-33983479 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001887`
名称	SmilChr01G001887
描述	vacuolar protein sorting-associated protein 2 homolog 2-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	33975491 - 33983479 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006774`
GeneID	`131006774`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006774`
原始查询	`SmilChr01G001887`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	vacuolar protein sorting-associated protein 2 homolog 2-like
产物	vacuolar protein sorting-associated protein 2 homolog 2-like
Arabidopsis	`AT5G44560` (VPS2.2) SNF7 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834483] identity=81.1; qcov=0.562; evalue=4.64e-125; confidence=medium
Rice	`Os03g0639800` (OsVPS2) - identity=76; qcov=0.58; evalue=2.51e-114; confidence=medium
GO	GO:0000815 (ESCRT III complex); GO:0005771 (multivesicular body); GO:0015031 (protein transport); GO:0032509 (endosome transport via multivesicular body sorting pathway); GO:0045324 (late endosome to vacuole transport)
KEGG	smil04144 (Endocytosis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF03357 (Snf7); PF06943 (zf-LSD1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006774

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057789895.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057789895.1`
3	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057789895.1`
4	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057789895.1`
5	Vesicle	囊泡	0.20000	`XP_057789895.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:33977166`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35
`Chr1:33977199`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A10,C31,C42
`Chr1:33980678`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B121,B61,B65,B81,C80
`Chr1:33981044`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B32,B69
`Chr1:33981047`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B2
`Chr1:33981598`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B77

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789895.1

395 aa

198

395

Snf7

zf-LSD1

PF03357 Snf7 20-187 aa PF06943 zf-LSD1 225-249 aa PF06943 zf-LSD1 264-288 aa PF06943 zf-LSD1 305-329 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789895.1`	Pfam	`PF03357`	Snf7	Family	20	187	3.3e-36	125.3	Snf7
`XP_057789895.1`	Pfam	`PF06943`	zf-LSD1	Domain	225	249	2.1e-36	124.2	LSD1 zinc finger
`XP_057789895.1`	Pfam	`PF06943`	zf-LSD1	Domain	264	288	2.1e-36	124.2	LSD1 zinc finger
`XP_057789895.1`	Pfam	`PF06943`	zf-LSD1	Domain	305	329	2.1e-36	124.2	LSD1 zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933912.1
ACAACGGCTACGTTCATCATAGATTCATAGCCGTTGATGTGCAATAAACAAAAACACGCTCGTCGAGGCAATAGTTCGCCCCCCTCTTTCCACTTTCCAGTTGGAGACTGAAAGTGAGAATTGAAGAAATTGTCCATTTCTTAAACACTGTTTGTTGAATCAATAGCCATTAACCAGATCTTCCCCATTTCTTGCTCGTCCCAAATCTTAGGGTTTCTTTTGATCAAGCACTACAAACATCTCTGCAGCTTTTTTAGAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131006774
ATGAATCTCAACATCTTCAAGAAGAAAACTTCGCCTAAAGATGCGCTGCGAACAAGTAAAAGAGAAATGGCGGTTGCCACAAGAGGCATTGAACGTGAAATTGCATCTTTGCAGATGGAGGAGAGGAGATTAGTGGCAGAGATCAAGAAAACTGCTAAAACAGGAAATGAGGCTGCAACAAAAATCTTAGCTCGACAATTAGTTCGGCTTCGGCAGCAAATCACAAACTTGCAGGGCAGCCGTGCCCAGATCAGAGGTGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057789895.1
MNLNIFKKKTSPKDALRTSKREMAVATRGIEREIASLQMEERRLVAEIKKTAKTGNEAATKILARQLVRLRQQITNLQGSRAQIRGVATHTQALYASTSISTGMKGATKAMSAMNKQMQPARQTKMIREFQQQAAQMDMTIEMMSEAIDETLDKDEAEEETEELTNQVLDEIGVDIASQLSSAPKGRIASKKVENAAPSAAASTDVEDLEKRLASLRHMQSQVVCSGCRTVLLYPSGATNVCCAVCNMVTSVPPPGMEMA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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