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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002043`

染色体: Chr01 坐标: 36131932-36134712 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002043`
名称	SmilChr01G002043
描述	probable glucan endo-1,3-beta-glucosidase A6
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	36131932 - 36134712 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022961`
GeneID	`131022961`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022961`
原始查询	`SmilChr01G002043`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable glucan endo-1,3-beta-glucosidase A6
产物	probable glucan endo-1%2C3-beta-glucosidase A6
Arabidopsis	`AT3G07320` (AT3G07320) O-Glycosyl hydrolases family 17 protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819920] identity=61.7; qcov=0.98; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os09g0502200` - identity=49.5; qcov=0.98; evalue=1.52e-154; confidence=high
GO	GO:0004553 (hydrolase activity, hydrolyzing O-glycosyl compounds); GO:0005886 (plasma membrane); GO:0005975 (carbohydrate metabolic process)
KEGG	-
Pfam	PF00332 (Glyco_hydro_17); PF07983 (X8)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022961

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell wall	细胞壁	0.80000	`XP_057808485.1`
2	Secreted	分泌到胞外	0.60000	`XP_057808485.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057808485.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808485.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808485.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:36132261`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B4,C86
`Chr1:36132261`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B4,C86
`Chr1:36132654`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B109
`Chr1:36132655`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A7,B56,B96,C10,C76
`Chr1:36132673`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C10,C32
`Chr1:36132704`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B24,B27,B36,C47,C49
`Chr1:36132740`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C1
`Chr1:36132740`	`A`	`AC`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C1
`Chr1:36132748`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B66
`Chr1:36132853`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr1:36132892`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B29
`Chr1:36133294`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C37,D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808485.1

455 aa

228

455

Glyco_hydro_17

PF00332 Glyco_hydro_17 24-346 aa PF07983 X8 365-437 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808485.1`	Pfam	`PF00332`	Glyco_hydro_17	Domain	24	346	1.2e-92	311.5	Glycosyl hydrolases family 17
`XP_057808485.1`	Pfam	`PF07983`	X8	Domain	365	437	1.5e-18	67.9	X8 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952502.1
GAAGTCGCAACAAAACCAAACCCGGAATCACGTCCAACTCACACTTCGCTCGGTACAACCTTGAAATTACACACACACATGTTCCTATTCCTAATCCCTGGACTTTGCCCTGTCTTCGTCAATCTCAACGTTCCATCCACGTTTCTCTTTCTCTCCCCCCGCAATTAAGACAAATCTATGTTCATTAGTTTGCACTTAAATTCAATACACTATTAATAGAAGCGTCATTCGCTGCTTCATCTCCAAATACTCTGCTGCGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022961
ATGGTGTTTTGCTATGCGCTTCTGCTTCTCCTCACGGCTTCTCTCTCATATGGAGCAATGCAACCGAAAGTCGGCGTCTGCTACGGCGACCTCGGCAACAATCTCCCCAGCCGGCAAAAATCCGTGGAGCTAATCCAAAAGCTCAACGCCAAACGCATCAAAATCTACGGCGCCAATGCCGCAACGCTCAAGGCGATCCAGGGCACCGACCTCCAAATCTCAATCATGCTCCCAAACGACCTCATCCCCGCCGCCGCCGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808485.1
MVFCYALLLLLTASLSYGAMQPKVGVCYGDLGNNLPSRQKSVELIQKLNAKRIKIYGANAATLKAIQGTDLQISIMLPNDLIPAAAANQTFADEWVKSNVSPFYPKSKIRYLLVGNEILSNQPNSTWFKLVPAMRRIRYSVKKFGLKKIKVGTPLAMDCLEASYPPSAGAFRSDVADRVIKPMLRFLDRTKSFFFVDVYTYFAWISNPIDINLDYALLQPTNITISDPVSGLKYTNLLDQMLDALYFAMKRAGYPNIRLF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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