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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002052`

染色体: Chr01 坐标: 36320151-36322993 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002052`
名称	SmilChr01G002052
描述	asparagine--tRNA ligase, cytoplasmic 2-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	36320151 - 36322993 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023009`
GeneID	`131023009`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023009`
原始查询	`SmilChr01G002052`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	asparagine--tRNA ligase, cytoplasmic 2-like
产物	asparagine--tRNA ligase%2C cytoplasmic 2-like
Arabidopsis	`AT3G07420` (NS2) asparaginyl-tRNA synthetase 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819930] identity=47.8; qcov=1.06; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0372700` - identity=40.6; qcov=0.986; evalue=1e-148; confidence=medium
GO	GO:0004816 (asparagine-tRNA ligase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0005739 (mitochondrion); GO:0006421 (asparaginyl-tRNA aminoacylation)
KEGG	smil00970 (Aminoacyl-tRNA biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00152 (tRNA-synt_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023009

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057808532.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057808532.1`
3	Mitochondrion	线粒体	0.20000	`XP_057808532.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057808532.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808532.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:36320614`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C83
`Chr1:36320851`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B14,C70
`Chr1:36321131`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B117,C27,C78,C83
`Chr1:36321140`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A18,B100
`Chr1:36321191`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B47
`Chr1:36321268`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A10,B122
`Chr1:36321373`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B106,B27,C61
`Chr1:36321468`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B134,B65,C46
`Chr1:36321531`	`GCA`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B14
`Chr1:36321531`	`GCA`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B14
`Chr1:36321752`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B78,B99

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808532.1

584 aa

292

584

tRNA-synt_2

PF00152 tRNA-synt_2 306-577 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808532.1`	Pfam	`PF00152`	tRNA-synt_2	Domain	306	577	1.5e-33	116.9	tRNA synthetases class II (D, K and N)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952549.1
TACCAATCCTCCCCTCCTTCCTTCTTCTTCCTCCTCTCTCTCAAACAATCCCTTTCCTTTCTCTCTCTAACTCTCCTTCTCTCTCAACACTTCCTCAAGCAACGCATCATTTCTCCTCCATCCCCATCAACATATATGTATATATACTCTCTTCTCCAACAATTCCCACCAAAATCAAACAACACACACACACACACACTTGTTCATCTCAAAACTTTTTCCGGCGAAATCCCTCTCCTCCGAAATGGCCTCCGAGCAAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023009
ATGGCCTCCGAGCAAGCTCCGGTAGAATCCCCACTACCCCTCTCCAAATACTCCAAAAGGGTCACCTTGGACTCAATCTCCAGCCGCCCAGACGGCGGCGTGGGGCTGATCGGACAGAGGGTGGTCGTCGGGGGCTGGGTCAAGTCCTCCCGGGAATTCAAGGCGGCGGCGCCGCCTCCCGCCGCCGGAGCCCCCAAAGACATCAGCTGCGTCGAAGTCCTCCAAACAAAGCTCCCCTTTTTCCGGTCGATCATAAAGGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808532.1
MASEQAPVESPLPLSKYSKRVTLDSISSRPDGGVGLIGQRVVVGGWVKSSREFKAAAPPPAAGAPKDISCVEVLQTKLPFFRSIIKVFGGEQRIRDKIESVLPKPPQPSISILQISDGSCVSSLQVVVDSGLAPPAHIMATGTCILVEGLFQKPSLLEKEKYRIEVKADNILHIGSVDQDRYPLSKKRLPLELLRDSAHFRPRTTTVASVMRIRNGLTQAAHTFFQENGFLLVQVPVITATDCDGLGQSLVVAEAQERSR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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