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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002083`

染色体: Chr01 坐标: 36770893-36775170 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002083`
名称	SmilChr01G002083
描述	uncharacterized SmilChr01G002083
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	36770893 - 36775170 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023231`
GeneID	`131023231`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023231`
原始查询	`SmilChr01G002083`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826917]; symbol=AT4G13030; hit=AT4G13030; species=arabidopsis; confidence=high
产物	P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826917]; symbol=AT4G13030; hit=AT4G13030; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT4G13030` (AT4G13030) P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826917] identity=48.3; qcov=0.765; evalue=2.41e-87; confidence=high
Rice	`Os05g0274300` - identity=43.8; qcov=0.64; evalue=1.19e-66; confidence=medium
GO	GO:0005525 (GTP binding)
KEGG	-
Pfam	PF01926 (MMR_HSR1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023231

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus membrane	核膜	0.20000	`XP_057808758.1`
2	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057808758.1`
3	Chloroplast	叶绿体	0.20000	`XP_057808758.1`
4	Chloroplast membrane	叶绿体膜	0.20000	`XP_057808758.1`
5	Lipid droplet	脂滴	0.20000	`XP_057808758.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:36772602`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B72
`Chr1:36772689`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C5
`Chr1:36773034`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A18,B129
`Chr1:36773068`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B71,C25,C54,C56
`Chr1:36773102`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B127
`Chr1:36773241`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B138
`Chr1:36773259`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B127
`Chr1:36773287`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B72
`Chr1:36773344`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B71,C25,C54,C56
`Chr1:36773349`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B127,B94,C1,C20
`Chr1:36773521`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A21,B33,B69,C87
`Chr1:36773543`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A21,B33,B69,C87

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808758.1

425 aa

212

425

MMR_HSR1

PF01926 MMR_HSR1 136-219 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808758.1`	Pfam	`PF01926`	MMR_HSR1	Family	136	219	4e-05	24.4	50S ribosome-binding GTPase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XR_009101449.1
ACCACGTCATGTCACTTAGAGGTGATATCCCAGTTGAGTTCGGATTCTACTCTTTTCACTCTCTCTCTCGCTGAGCTTCCTTTCTCTCTCTAGAATTTGGAGTGAGCGAGAGCGATCATGGGTGGCGATAGTTTCGGCTCTTCTCCCCCTTCAACTGAGGATGTATCGTTATCCAGCCAAGGTTTCCCACATGGCTCCGTTAAGTCCAGTGCTTCAAGTGGAGATGAGGAGTGTTTGTGTCATAAATTAGAGAACGGTTC...

XM_057952775.1
AGAATACAAATTATTTGTATTTTTTTAAAGGAAAAAACAGTAAACTACCACGTCATGTCACTTAGAGGTGATATCCCAGTTGAGTTCGGATTCTACTCTTTTCACTCTCTCTCTCGCTGAGCTTCCTTTCTCTCTCTAGAATTTGGAGTGAGCGAGAGCGATCATGGGTGGCGATAGTTTCGGCTCTTCTCCCCCTTCAACTGAGGATGTATCGTTATCCAGCCAAGGTTTCCCACATGGCTCCGTTAAGTCCAGTGCTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023231
ATGGGTGGCGATAGTTTCGGCTCTTCTCCCCCTTCAACTGAGGATGTATCGTTATCCAGCCAAGGTTTCCCACATGGCTCCGTTAAGTCCAGTGCTTCAAGTGGAGATGAGGAGTGTTTGTGTCATAAATTAGAGAACGGTTCAGTGATCAACTGCGTGAGGGTTTCTGATTCCGGTGATTCTTCGGATGCCGATCGTCTTAGAAATTCAATTCGTGAGGCCGCTGAGAGGCAGAAATTGAAGGTTTACACAGAAGTTTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808758.1
MGGDSFGSSPPSTEDVSLSSQGFPHGSVKSSASSGDEECLCHKLENGSVINCVRVSDSGDSSDADRLRNSIREAAERQKLKVYTEVLRSYEDLQSKIERFEEAKSTILSYTPGSWADKASCMDLRECDVPNTTSFLVIGPKSSGKSSLVNKISRVFEDDVFQPPRAQVSCSSSPEDGTYFLHEYSIPRNSGSFCLYDTPGLSADSSKNLKMIERWMTHGVHHGELIIRESDSKTLKAQLKCRARRGFFSGQVRPIDFVIF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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