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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002106`

染色体: Chr01 坐标: 37078139-37080688 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002106`
名称	SmilChr01G002106
描述	uncharacterized SmilChr01G002106
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	37078139 - 37080688 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131007556`
GeneID	`131007556`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131007556`
原始查询	`SmilChr01G002106`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0704400; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os06g0704400; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G05850` (MUG7) MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3768859] identity=25.1; qcov=0.652; evalue=2.06e-51; confidence=low
Rice	`Os06g0704400` - identity=33.7; qcov=0.745; evalue=2e-93; confidence=low
GO	GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF00872 (Transposase_mut); PF04434 (SWIM); PF10551 (MULE); PF26130 (PB1-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131007556

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057790453.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057790453.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057790453.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057790453.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057790453.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:37078210`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr1:37078235`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	D5
`Chr1:37078235`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	D5
`Chr1:37078327`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B12,B131
`Chr1:37078333`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B112,B120,D4
`Chr1:37078335`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B54,C28,C35
`Chr1:37078378`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B130
`Chr1:37078378`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B130
`Chr1:37078393`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A24,B46,D3
`Chr1:37078471`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B137,B3,B35,B50
`Chr1:37078493`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B129
`Chr1:37078514`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B133,B134,B16,C51,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790453.1

768 aa

384

768

PB1-like

MULE

Transposase_mut

SWIM

PF26130 PB1-like 5-101 aa PF10551 MULE 472-567 aa PF00872 Transposase_mut 490-606 aa PF04434 SWIM 720-747 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057790453.1`	Pfam	`PF26130`	PB1-like	Domain	5	101	1.3e-15	58.2	PB1-like domain
`XP_057790453.1`	Pfam	`PF10551`	MULE	Domain	472	567	4.1e-17	63.1	MULE transposase domain
`XP_057790453.1`	Pfam	`PF00872`	Transposase_mut	Family	490	606	2.9e-06	27.1	Transposase, Mutator family
`XP_057790453.1`	Pfam	`PF04434`	SWIM	Domain	720	747	5e-08	33.0	SWIM zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934470.1
ATGGACGACAGCGATGAATTTGGGTTGTGTATATATCACGGAGGGAAGTTCGCTACGATAGGAACAAGCAGCAGATTGTATTCTGGTGGTGAATTGACATCTAGATATGGCTTAGATAGAGATAGGTTTGGCTATCTTGATTTGGAGGAGGAAGTACAGAAATTAGGATACGTATCTTGGAAGTGTCTAGCATATAAGGTCCCTAGAACTCTTGTTTATATGGAATTATCTGAGGATAAGCATGTGATGCAAATGTTGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131007556
ATGGACGACAGCGATGAATTTGGGTTGTGTATATATCACGGAGGGAAGTTCGCTACGATAGGAACAAGCAGCAGATTGTATTCTGGTGGTGAATTGACATCTAGATATGGCTTAGATAGAGATAGGTTTGGCTATCTTGATTTGGAGGAGGAAGTACAGAAATTAGGATACGTATCTTGGAAGTGTCTAGCATATAAGGTCCCTAGAACTCTTGTTTATATGGAATTATCTGAGGATAAGCATGTGATGCAAATGTTGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057790453.1
MDDSDEFGLCIYHGGKFATIGTSSRLYSGGELTSRYGLDRDRFGYLDLEEEVQKLGYVSWKCLAYKVPRTLVYMELSEDKHVMQMLKHISRSCRSISVYVDDGKREVVKAVTEVVTKTVTKTITTTKRSVGKGGGKSEKVKEKVDVGGQKVDKGKGKVEQGGEKGEVGDDVVSQYSQLTDAAEWSTDEDDDDYCPGEEDEELVESEDSLGDMELGSDDDEYEQARVNLREGLGVLGDNMSDNELSLEAENSDSCDSDGQL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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