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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002165`

染色体: Chr01 坐标: 37730155-37734418 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002165`
名称	SmilChr01G002165
描述	protein ALTERED PHOSPHATE STARVATION RESPONSE 1-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	37730155 - 37734418 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131007720`
GeneID	`131007720`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131007720`
原始查询	`SmilChr01G002165`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein ALTERED PHOSPHATE STARVATION RESPONSE 1-like
产物	protein ALTERED PHOSPHATE STARVATION RESPONSE 1-like
Arabidopsis	`AT1G21740` (AT1G21740) DUF630 family protein, putative (DUF630 and DUF632) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838778] identity=38.3; qcov=0.939; evalue=4.73e-139; confidence=medium
Rice	`Os05g0425000` - identity=33.9; qcov=0.786; evalue=2.86e-86; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04782 (DUF632); PF04783 (DUF630)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131007720

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057790630.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057790630.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057790630.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057790630.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057790630.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:37731128`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B109,B79,C39
`Chr1:37731130`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41
`Chr1:37731188`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B90,B92
`Chr1:37731188`	`T`	`TA`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B90,B92
`Chr1:37731238`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B65,B78,D8
`Chr1:37731255`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:37731276`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B65,B78,D8
`Chr1:37731285`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B35,C64,C66,C79
`Chr1:37731299`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B35,C64,C66,C79
`Chr1:37731353`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	7	B110,B125,B135,B45,B79,C16,C30
`Chr1:37731423`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B35,C64
`Chr1:37731428`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A23

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790630.1

785 aa

392

785

DUF630

DUF632

PF04783 DUF630 1-59 aa PF04782 DUF632 357-670 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057790630.1`	Pfam	`PF04783`	DUF630	Family	1	59	1.4e-25	89.9	Protein of unknown function (DUF630)
`XP_057790630.1`	Pfam	`PF04782`	DUF632	Family	357	670	2.9e-83	280.5	Protein of unknown function (DUF632)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934647.1
TCTAAATTAGAGCATCAAATATTAAATTCCGAAAAAAAAAAAAAAAGAATTCTAGTTTCCGCCATAGCTGATTTGCATGCGATTGTGCAGAGAGCTAAACCAAAATCACATCTTCAAATGCATATCTAAAGCATTTTTCCATGGCGATTTTCTGACATGGGGTGTAGTGGCTCGAAGACGGACGATCTGCCGCTGGTGGTCCGCTGCCGCGAGCGGCGGGAGCTCATACGCGCCGCCGCCAACCACCGCTACGTCCTCGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131007720
ATGGGGTGTAGTGGCTCGAAGACGGACGATCTGCCGCTGGTGGTCCGCTGCCGCGAGCGGCGGGAGCTCATACGCGCCGCCGCCAACCACCGCTACGTCCTCGCCGCCGCCCACGTTTCCTATTTCCGCTCGCTCAAAGACGTCGGCGATGCTCTGCGGAGATTCATCGACGAGGAATTGGTAGCTCCGTCAACTTCGCCTTCGCCGCCTCCGATTTCGCCTCCGTCTTCAAAGCTCGATGTTGAATCTCTGCATTTGCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057790630.1
MGCSGSKTDDLPLVVRCRERRELIRAAANHRYVLAAAHVSYFRSLKDVGDALRRFIDEELVAPSTSPSPPPISPPSSKLDVESLHLHDDDEEESDWCISDSSTDDDGDPEDMHHHDVEKSPSYYSGRVYYMKKSAPPPPHTKTAVPPQPHRGRSDSYWNSASGKYGGDEGVFTVTPARKTPPPPSPNPSALGFLSRFDVFDVFDGECVGLISSGDHEHAMNSVSPNSSKVMEKERFCKLGEETEHLVCREALKGKSSIKS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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