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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002283`

染色体: Chr01 坐标: 39613927-39619515 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002283`
名称	SmilChr01G002283
描述	uncharacterized SmilChr01G002283
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	39613927 - 39619515 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015005`
GeneID	`131015005`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015005`
原始查询	`SmilChr01G002283`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	PCNA domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827497]; symbol=AT4G17760; hit=AT4G17760; species=arabidopsis; confidence=high
产物	PCNA domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827497]; symbol=AT4G17760; hit=AT4G17760; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT4G17760` (AT4G17760) PCNA domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827497] identity=73.9; qcov=0.97; evalue=5e-168; confidence=high
Rice	`Os06g0132600` (OsRAD1) - identity=72; qcov=1; evalue=2.04e-167; confidence=high
GO	GO:0000077 (DNA damage checkpoint signaling); GO:0006281 (DNA repair); GO:0030896 (checkpoint clamp complex)
KEGG	-
Pfam	PF02144 (Rad1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015005

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057799185.1`
2	Nucleoplasm	核质	0.80000	`XP_057799185.1`
3	Chromosome	染色体	0.80000	`XP_057799191.1`
4	Nuclear body	核内小体	0.20000	`XP_057799185.1`
5	PML body	PML body	0.20000	`XP_057799185.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:39614400`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	B90,B92,C37
`Chr1:39614400`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B90,B92,C37
`Chr1:39614458`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A18,B89,B94,C39
`Chr1:39614630`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr1:39614651`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C13
`Chr1:39619028`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D3

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057799185.1

305 aa

152

305

Rad1

PF02144 Rad1 15-196 aa

XP_057799191.1

304 aa

152

304

Rad1

PF02144 Rad1 15-233 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057799185.1`	Pfam	`PF02144`	Rad1	Family	15	196	6.2e-19	68.8	Repair protein Rad1/Rec1/Rad17
`XP_057799191.1`	Pfam	`PF02144`	Rad1	Family	15	233	1.7e-22	80.4	Repair protein Rad1/Rec1/Rad17

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057943202.1
AGCAAGTATACATATTGCGTACCCAACCAAATCAGTCTTCCCTCATTTTTGGCGGGAAAAAGGAGTGGTCACCGGCGGCGACACAATGAGCTCGTCAGCGGCGGTAGATACCGAGGCAGACTTGGTCTGCGAACTGGACAGCGTACGAGGCGTTGTAGATGCCCTCTGCTCCGTTCGGTGGAAGCGCTTTCAAGACGCTCTCGTTGAATTATCTGAACACGGTATAGTCATAATCGTCGAGGAAACCGGCTGTCTTCAGG...

XM_057943208.1
GCAAGTATACATATTGCGTACCCAACCAAATCAGTCTTCCCTCATTTTTGGCGGGAAAAAGGAGTGGTCACCGGCGGCGACACAATGAGCTCGTCAGCGGCGGTAGATACCGAGGCAGACTTGGTCTGCGAACTGGACAGCGTACGAGGCGTTGTAGATGCCCTCTGCTCCGTTCGGTGGAAGCGCTTTCAAGACGCTCTCGTTGAATTATCTGAACACGGTATAGTCATAATCGTCGAGGAAACCGGCTGTCTTCAGGC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131015005
ATGAGCTCGTCAGCGGCGGTAGATACCGAGGCAGACTTGGTCTGCGAACTGGACAGCGTACGAGGCGTTGTAGATGCCCTCTGCTCCGTTCGGTGGAAGCGCTTTCAAGACGCTCTCGTTGAATTATCTGAACACGGTATAGTCATAATCGTCGAGGAAACCGGCTGTCTTCAGGCCAAGGTTTACTTACAACGCGAGTTATTTATCAAATATGATTACCGGGCGACCGGCCGGCCACGATTCGGGGTTAGCTTGGGGCT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057799185.1
MSSSAAVDTEADLVCELDSVRGVVDALCSVRWKRFQDALVELSEHGIVIIVEETGCLQAKVYLQRELFIKYDYRATGRPRFGVSLGLFIDCLNTFSVPGRSNILELCYPGPDMQLMLRSVDSPDACIYAEIRTRIPETISWDYNFEPAGSTPLSFTVKSAALKEAIDDLEWPGASIQIALQPAPPSVIFRGEGHGDLQVCFLLAYHAQLLITLAEVLRRALVRYKYKFLRATTSNIPASVLKDNRGSKATIGRGGMLKIQ...

XP_057799191.1
MSSSAAVDTEADLVCELDSVRGVVDALCSVRWKRFQDALVELSEHGIVIIVEETGCLQAKVYLQRELFIKYDYRATGRPRFGVSLGLFIDCLNTFSVPGRSNILELCYPGPDMQLMLRSVDSPDACIYAEIRTRIPETISWDYNFEPAGSTPLSFTVKSAALKEAIDDLEWPGASIQIALQPAPPSVIFRGEGHGDLQIDFNYYANTDLLIAFSCDRQVSHRYKYKFLRATTSNIPASVLKDNRGSKATIGRGGMLKIQH...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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