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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002300`

染色体: Chr01 坐标: 39823665-39830374 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002300`
名称	SmilChr01G002300
描述	probable trehalase
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	39823665 - 39830374 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015208`
GeneID	`131015208`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015208`
原始查询	`SmilChr01G002300`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable trehalase
产物	probable trehalase
Arabidopsis	`AT4G24040` (TRE1) trehalase 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828504] identity=56.5; qcov=0.969; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os10g0521000` (OsTRE) - identity=58.1; qcov=0.957; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004555 (alpha,alpha-trehalase activity); GO:0005993 (trehalose catabolic process)
KEGG	smil00500 (Starch and sucrose metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01204 (Trehalase); PF22422 (MGH1-like_GH)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015208

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	0.40000	`XP_057799475.1`
2	Vacuole	液泡	0.40000	`XP_057799475.1`
3	Golgi apparatus	高尔基体	0.20000	`XP_057799475.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057799475.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057799475.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:39824441`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B22,B41
`Chr1:39824456`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B22,B41
`Chr1:39824495`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B75,C40
`Chr1:39824688`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B22
`Chr1:39824960`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	A15
`Chr1:39824960`	`T`	`TA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	A15
`Chr1:39825312`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B103,C26,C76,C9
`Chr1:39826240`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B103,C26,C76,C9
`Chr1:39829685`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr1:39829864`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B1,B7
`Chr1:39829879`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C40
`Chr1:39829904`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B13,C11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057799475.1

586 aa

293

586

Trehalase

MGH1-like_GH

PF01204 Trehalase 65-576 aa PF22422 MGH1-like_GH 209-530 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057799475.1`	Pfam	`PF01204`	Trehalase	Repeat	65	576	2.3e-174	581.7	Trehalase
`XP_057799475.1`	Pfam	`PF22422`	MGH1-like_GH	Repeat	209	530	9.3e-12	45.9	Mannosylglycerate hydrolase MGH1-like glycoside hydrolase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057943492.1
AATGTTGAAACACAGATTGGAATCAAATAAAAGTTTGGAGTAAATTTCATTAATTAATAAATTCAAAGTGCGTGTATTCCTAGGGCCGGCTTTGTAGGTTTATTCCCTCAAAATCGTAGATATGCATCCTACGCATATACACGCAATCATGTATCTCTCATAAACATGGAACACAAATCATTATCACAGATCATCGCCACTCTCTTCGCCTTCTCACTCATGGGCAATTCTAGCGTTACCGTCACAGCAGATGCATGCGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015208
ATGGAACACAAATCATTATCACAGATCATCGCCACTCTCTTCGCCTTCTCACTCATGGGCAATTCTAGCGTTACCGTCACAGCAGATGCATGCGGCCCGAAACCGTCGGGCCCGATCGTGCCGACGACTCCGTTAATCAAATTTCTCGAGCGGCTTCAAGAGACGGCTCTCCAAACGTACGGCCACAAGGACTTTGACCCAAAGCTCTACGTAGACCTGTCACTCAAGCAAAACCTCTCGGCCACGGTCGAAGCCTTCGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057799475.1
MEHKSLSQIIATLFAFSLMGNSSVTVTADACGPKPSGPIVPTTPLIKFLERLQETALQTYGHKDFDPKLYVDLSLKQNLSATVEAFDKLPRNGSGSVRAGELNRFVEEYLGGAEEDLVVAVPVDFVAEPEGFLVKVESPEVRAWALKVHHLWKNLTRKVSGRVLEKPDFHTLLPLGNPVIIPGSRFREVYYWDSYWIIRGLLASKMYETAKGMVYNLISLVDEFGYVLNGARAYYTNRSQPPLLSSMVVDVYNRTRDETL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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