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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002336`

染色体: Chr01 坐标: 40535384-40537096 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002336`
名称	SmilChr01G002336
描述	phospholipase A1-Ibeta2, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	40535384 - 40537096 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006453`
GeneID	`131006453`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006453`
原始查询	`SmilChr01G002336`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	phospholipase A1-Ibeta2, chloroplastic
产物	phospholipase A1-Ibeta2%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT4G16820` (PLA-I{beta]2) alpha/beta-Hydrolases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827388] identity=58; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0653900` (OsDAD1) - identity=47; qcov=1.07; evalue=2.46e-149; confidence=high
GO	GO:0004620 (glycerophospholipase activity); GO:0006629 (lipid metabolic process)
KEGG	-
Pfam	PF01764 (Lipase_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006453

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057789595.1`
2	Chloroplast membrane	叶绿体膜	0.60000	`XP_057789595.1`
3	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.40000	`XP_057789595.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057789595.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057789595.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:40535588`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B74,C28,C46
`Chr1:40535642`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B74,C28
`Chr1:40535678`	`C`	`CG`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C28
`Chr1:40535678`	`C`	`CG`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C28
`Chr1:40535697`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B95,C21,C73,C81
`Chr1:40535762`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C22
`Chr1:40535913`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C11
`Chr1:40535978`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B108,B56,B96,C23,D7
`Chr1:40535984`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B78,D2
`Chr1:40535991`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B21
`Chr1:40535991`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B21
`Chr1:40536044`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789595.1

521 aa

260

521

Lipase_3

PF01764 Lipase_3 250-397 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789595.1`	Pfam	`PF01764`	Lipase_3	Domain	250	397	2.6e-33	115.6	Lipase (class 3)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933612.1
CTGTCACAGACAACTTGATTTCAGTTCTCTCTCTCTAAACCTCTTCCTTTTCTTCTCCATCATCATGATGCAAATCGGAGCAACACTTCCCGCACACAATCTCCAAGTATTTCAGGTGAGGCGGGCCGTGTTCGAATGCTCGGGCTCACCTCTCAACCCCCACAAACGGGCCCCGGCCCGAAACTCGCCGGAGAATTTATCCACCGACATGACGAGGAAGCATCTATCCAACCTCGAAAGACTGCTGCAGAAGCAGTCCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131006453
ATGATGCAAATCGGAGCAACACTTCCCGCACACAATCTCCAAGTATTTCAGGTGAGGCGGGCCGTGTTCGAATGCTCGGGCTCACCTCTCAACCCCCACAAACGGGCCCCGGCCCGAAACTCGCCGGAGAATTTATCCACCGACATGACGAGGAAGCATCTATCCAACCTCGAAAGACTGCTGCAGAAGCAGTCCCACCCGAATCCGCCGCCCGGCCCGGAGGCCGAACCCGAACCCGAACCCGAAACCCGGACCAGAGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057789595.1
MMQIGATLPAHNLQVFQVRRAVFECSGSPLNPHKRAPARNSPENLSTDMTRKHLSNLERLLQKQSHPNPPPGPEAEPEPEPETRTRGILEGLTLWPEMKAAEEMSPRHLNRLQRLLSKSAEYSPRNSLGCRWRDYHGANDWAGMLDPLDENLRREVVRSGEFIQAAYHGFHSKPATSPEEVQWPRHVALPDRSYRMTRSLYATASVGLPKWVDHVAPDLGWMTQRSSWVGYVAVCDDRREIQRMGRRDIVIALRGTATCL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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