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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002563`

染色体: Chr01 坐标: 43758175-43760421 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002563`
名称	SmilChr01G002563
描述	bifunctional dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase/dTDP-4-dehydrorhamnose reductase
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	43758175 - 43760421 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131026383`
GeneID	`131026383`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131026383`
原始查询	`SmilChr01G002563`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	bifunctional dTDP-4-dehydrorhamnose 3,5-epimerase/dTDP-4-dehydrorhamnose reductase
产物	bifunctional dTDP-4-dehydrorhamnose 3%2C5-epimerase/dTDP-4-dehydrorhamnose reductase
Arabidopsis	`AT1G63000` (NRS/ER) nucleotide-rhamnose synthase/epimerase-reductase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842603] identity=86.3; qcov=0.997; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0678400` - identity=81; qcov=1.04; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0006556 (S-adenosylmethionine biosynthetic process); GO:0048269 (methionine adenosyltransferase complex); GO:0048270 (methionine adenosyltransferase regulator activity)
KEGG	smil00541 (Biosynthesis of various nucleotide sugars - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01250 (Biosynthesis of nucleotide sugars - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01370 (Epimerase); PF04321 (RmlD_sub_bind)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131026383

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057812237.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057812237.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057812237.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057812237.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057812237.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:43758451`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C49
`Chr1:43758570`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B107,B66,C5,C62,D7
`Chr1:43758586`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A20,B72,C33,C46
`Chr1:43758654`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B51,B58,C22,C3,C82

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057812237.1

300 aa

150

300

RmlD_sub_bind

Epimerase

PF04321 RmlD_sub_bind 14-186 aa PF01370 Epimerase 16-178 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057812237.1`	Pfam	`PF04321`	RmlD_sub_bind	Domain	14	186	5.1e-13	49.5	RmlD substrate binding domain
`XP_057812237.1`	Pfam	`PF01370`	Epimerase	Family	16	178	1.3e-12	48.3	NAD dependent epimerase/dehydratase family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057956254.1
TCGAAATTGACAAGGTTAGTAGCGTCATTTAACGCATATGATGATTTTGCCCAAAACCAAAAAAAGAAAAAGAAAAGTTATGTCCGTATAAATATAAAAATCCATCACCACATTCATACAGCAAATGCACTAAACTCTCCCACCACATCCCATTCCCATCCCAATTTTCACGCACAACACACACCGAGCTCCGTCATGGGCGCCACCGCCAACGGCACGTCAGCTCAGCCCCTCAAGTTCCTGATCTACGGTCGCACCGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131026383
ATGGGCGCCACCGCCAACGGCACGTCAGCTCAGCCCCTCAAGTTCCTGATCTACGGTCGCACCGGCTGGATAGGCGGCCTGCTCGGCAAGCTCTGCGAGGCACAGAGCATCGACTACGTCTACGGGTCGGGCCGCCTCCAGAACCGGGTCGACCTGGAGGCCGACATCGCCGCCGTCAAGCCTACCCACGTATTCAACGCCGCCGGCGTCACCGGCCGCCCCAACGTCGACTGGTGCGAGTCTCACAAGGTCGAGACCAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057812237.1
MGATANGTSAQPLKFLIYGRTGWIGGLLGKLCEAQSIDYVYGSGRLQNRVDLEADIAAVKPTHVFNAAGVTGRPNVDWCESHKVETIRTNVVGTLTLADVCRDKGLVLINYATGCIFEYDAAHPLGSGIGFKEEDTPNFIGSFYSKTKAMVEDLLNNYENVCTLRVRMPISSDLSNPRNFITKITRYEKVVDIPNSMTILDELLPISIEMAKRNLTGIWNFTNPGVVSHNEILEMYRDYIDPKFTWKNFTLEEQAKVIVA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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