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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002676`

染色体: Chr01 坐标: 44962530-44969390 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002676`
名称	SmilChr01G002676
描述	loganic acid O-methyltransferase-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	44962530 - 44969390 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130985682`
GeneID	`130985682`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130985682`
原始查询	`SmilChr01G002676`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	loganic acid O-methyltransferase-like
产物	loganic acid O-methyltransferase-like
Arabidopsis	`AT1G68040` (AT1G68040) S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843132] identity=41.9; qcov=1.03; evalue=4.37e-89; confidence=medium
Rice	`Os04g0665200` (IAMT1) - identity=33.2; qcov=1.08; evalue=3.43e-54; confidence=low
GO	GO:0008757 (S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase activity); GO:0032259 (methylation)
KEGG	-
Pfam	PF03492 (Methyltransf_7)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130985682

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057764752.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057764752.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057764752.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057764752.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057764752.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:44962807`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B70,C13
`Chr1:44962901`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B132,C35,C70,C9,D11
`Chr1:44968281`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr1:44968353`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B132,B139,C35,C70,C9
`Chr1:44968656`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C33,C46,C65
`Chr1:44968692`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C46,C65
`Chr1:44968719`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B136
`Chr1:44968719`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B136
`Chr1:44968791`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C65
`Chr1:44969005`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C62,D7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057764752.1

347 aa

174

347

Methyltransf_7

PF03492 Methyltransf_7 4-322 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057764752.1`	Pfam	`PF03492`	Methyltransf_7	Domain	4	322	3.1e-99	333.1	SAM dependent carboxyl methyltransferase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057908769.1
TGATTTTATAAATAGAATATCGAGAAATGAGATTTGTACAACTTGAGGTTCATCATCACTCAAATTAAAGGGGTTAATTTTCATTTTCTTTCTGTTTTTGTCATACAGATTTCAGGAGAACATCATAAACAGAGGATTAATAATGGGTGAATCTTGTCCAATGAATGGCGGTGACGGTACATATAGCTACGCCAAGAACTCCACTGGGCAGAGAGATGTGGCACGTGCTGTGGAGGATGCAATAAAGGAGGCAGTGATGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130985682
ATGGGTGAATCTTGTCCAATGAATGGCGGTGACGGTACATATAGCTACGCCAAGAACTCCACTGGGCAGAGAGATGTGGCACGTGCTGTGGAGGATGCAATAAAGGAGGCAGTGATGGATAATCTTGATTTAGACAAGTTGCTGTGTGGTTCGACCAGATTCGCCGTCGCCGACTTAGGATGTTCGGTGGGGCCCAACACATTCTACTCCATGGAAACCATCATCAAAACCGTGCAACAAAAGTCGTCCACTAACAACCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057764752.1
MGESCPMNGGDGTYSYAKNSTGQRDVARAVEDAIKEAVMDNLDLDKLLCGSTRFAVADLGCSVGPNTFYSMETIIKTVQQKSSTNNLEFQVLFNDQIGNDFNTLFASLPQGRSYFAAAVAGSFHGRLFPSSSSIHIAYSSIAMHWLSKLPEGVAVKGSPAWNAGKIHYMGASDAVVKAYADRFEEDMEIFLRARAQEIVAGGMVVTLLPGVPNPDIQHYAAVALNFFESILIDMVKEGVLAQEEMDSFNVPSFFSCIEDM...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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