当前解析结果
SmilChr01G002843| 统一新 Gene ID | SmilChr01G002843 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G002843 |
| 描述 | O-fucosyltransferase 35 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 46996758 - 47002245 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130987549 |
|---|---|
| GeneID | 130987549 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130987549 |
| 原始查询 | SmilChr01G002843 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | O-fucosyltransferase 35 |
| 产物 | O-fucosyltransferase 35 |
| Arabidopsis | AT5G35570 (AT5G35570)O-fucosyltransferase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833522] identity=65.6; qcov=1; evalue=0; confidence=high |
| Rice | Os09g0442900- identity=56.1; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high |
| GO | GO:0005737 (cytoplasm); GO:0005794 (Golgi apparatus); GO:0009507 (chloroplast) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF10250 (O-FucT) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130987549 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Golgi apparatus | 高尔基体 | 1.00000 | XP_057767096.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057767096.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057767096.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057767096.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:46997435 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C2 |
Chr1:46997825 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C11,C69 |
Chr1:47001636 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B101,C39,D4 |
Chr1:47001643 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B109,B110,C36,C60,C77 |
Chr1:47001649 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B117,B90,C87 |
Chr1:47001650 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B100,B111,B112,B31,B57 |
Chr1:47001684 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B80,B82,C6,C85 |
Chr1:47001689 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B9,D1,D7 |
Chr1:47001698 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B134,B66,C43,D2,D5 |
Chr1:47001699 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B55,D4 |
Chr1:47001706 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B34,C7,D1 |
Chr1:47001709 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B104 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057767096.1PF10250
O-FucT 270-585 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057767096.1 |
Pfam | PF10250 |
O-FucT | Family | 270 | 585 | 2.8e-100 | 337.0 | GDP-fucose protein O-fucosyltransferase |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。