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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002858`

染色体: Chr01 坐标: 47160958-47163601 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002858`
名称	SmilChr01G002858
描述	RING-box protein 1a-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	47160958 - 47163601 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987662`
GeneID	`130987662`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987662`
原始查询	`SmilChr01G002858`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	RING-box protein 1a-like
产物	RING-box protein 1a-like
Arabidopsis	`AT5G20570` (RBX1) RING-box 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832179] identity=82.4; qcov=1; evalue=2.55e-71; confidence=high
Rice	`Os01g0106800` (OsRBX1b) - identity=75.4; qcov=1.01; evalue=5.44e-65; confidence=high
GO	GO:0005634 (nucleus); GO:0006511 (ubiquitin-dependent protein catabolic process); GO:0008270 (zinc ion binding); GO:0016567 (protein ubiquitination); GO:0031461 (cullin-RING ubiquitin ligase complex); GO:0061630 (ubiquitin protein ligase activity); GO:0097602 (cullin family protein binding)
KEGG	smil03420 (Nucleotide excision repair - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04120 (Ubiquitin mediated proteolysis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04141 (Protein processing in endoplasmic reticulum - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF12678 (zf-rbx1); PF12861 (zf-ANAPC11)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987662

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057767255.1`
2	Nucleoplasm	核质	1.00000	`XP_057767255.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057767255.1`
4	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057767255.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057767255.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:47161071`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B134,B138,B87,C35
`Chr1:47161107`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B105,B75
`Chr1:47163280`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B91

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767255.1

125 aa

125

zf-rbx1

zf-ANAPC11

PF12678 zf-rbx1 57-115 aa PF12861 zf-ANAPC11 57-121 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767255.1`	Pfam	`PF12678`	zf-rbx1	Domain	57	115	1.8e-25	89.6	RING-H2 zinc finger domain
`XP_057767255.1`	Pfam	`PF12861`	zf-ANAPC11	Domain	57	121	9.3e-13	48.7	Anaphase-promoting complex subunit 11 RING-H2 finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911272.1
CCATTCTCATATTTTACCATTATTACGAGACAGATATATATACTGCAACCAAATAATTCTGCACACGCAAACACAGCTACCTTTACCCAAGTAGAGATGGCGACGCTCGACACCGACGTCAACATGGTTCCGGCTGGAGAGGGCTCATCCGGCGCCGGCCCTTCCAACACCACGCCACAGCCGCCGCAGTCCTCCAAAAAATCCAAGAAATTTGAGATTAAAAAGTGGAACGCCGTCTCGCTCTGGGCTTGGGATATCGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130987662
ATGGCGACGCTCGACACCGACGTCAACATGGTTCCGGCTGGAGAGGGCTCATCCGGCGCCGGCCCTTCCAACACCACGCCACAGCCGCCGCAGTCCTCCAAAAAATCCAAGAAATTTGAGATTAAAAAGTGGAACGCCGTCTCGCTCTGGGCTTGGGATATCGTGGTCGATAATTGTGCTATTTGCAGGAACCATATAATGGATCTATGCATCGAGTGCCAAGCTAATCAAGCTAGTGCGACGAGCGAGGAATGCACGGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057767255.1
MATLDTDVNMVPAGEGSSGAGPSNTTPQPPQSSKKSKKFEIKKWNAVSLWAWDIVVDNCAICRNHIMDLCIECQANQASATSEECTVAWGVCNHAFHFHCISRWLKTRQVCPLDNSEWEFQKYGH

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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