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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002886`

染色体: Chr01 坐标: 47479713-47482005 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002886`
名称	SmilChr01G002886
描述	20 kDa chaperonin, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	47479713 - 47482005 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987936`
GeneID	`130987936`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987936`
原始查询	`SmilChr01G002886`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	20 kDa chaperonin, chloroplastic
产物	20 kDa chaperonin%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT5G20720` (CPN20) chaperonin 20 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832195] identity=72.5; qcov=1; evalue=6.03e-129; confidence=high
Rice	`Os06g0196900` (P0528E04.36-1) - identity=69; qcov=1.01; evalue=2.7e-122; confidence=high
GO	GO:0005524 (ATP binding); GO:0005759 (mitochondrial matrix); GO:0009507 (chloroplast); GO:0044183 (protein folding chaperone); GO:0046914 (transition metal ion binding); GO:0051082 (GO:0051082); GO:0051085 (GO:0051085); GO:0051087 (protein-folding chaperone binding); GO:1901671 (positive regulation of superoxide dismutase activity)
KEGG	-
Pfam	PF00166 (Cpn10)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987936

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057767631.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.60000	`XP_057767631.1`
3	Chloroplast thylakoid	类囊体	0.20000	`XP_057767631.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057767631.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057767631.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:47480041`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B139
`Chr1:47480091`	`TGA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C65
`Chr1:47480091`	`TGA`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C65
`Chr1:47480132`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B40
`Chr1:47480177`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B139
`Chr1:47480885`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B30,B64,C16
`Chr1:47481028`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B105,B14,B57,B75,C54
`Chr1:47481382`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:47481652`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A21,C43

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057767631.1

258 aa

129

258

Cpn10

PF00166 Cpn10 67-156 aa PF00166 Cpn10 165-256 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057767631.1`	Pfam	`PF00166`	Cpn10	Domain	67	156	1.2e-60	202.2	Chaperonin 10 Kd subunit
`XP_057767631.1`	Pfam	`PF00166`	Cpn10	Domain	165	256	1.2e-60	202.2	Chaperonin 10 Kd subunit

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911648.1
ACCAACATTAAAAACACATCCAAAATATTCTAGAACCCTCTTATTATTTGCAGAAAACCCCCTCCTGAACTTTCTAGGGTTTTGTTATCCTCTTTCTTAACCAATCCACCATTTTATCATTACTACCCATATCTTTTCCTACACACTCCTCTCACTTAGCCTATCACCACTTTCCTTTCTCATTTGTTTCAGTTTGATAGCTGAAGAAATGGCAGCTGCACAGTTGACCTCCGCTGCTTCCTCAATTTCAGCAGCAAAAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130987936
ATGGCAGCTGCACAGTTGACCTCCGCTGCTTCCTCAATTTCAGCAGCAAAAGGATTTGCTTCATTTGAAGGTCTGAGAGCTACGCAGTCTGTGAATATTGCATCGTTTTCACCTCTGAAGCAGAATGGACTATCTTTCAGGTCGTTCCGTGGCCTTGTTGTCAAGGCGGCTACAGCTGTTGCCCCTAAGTACACAACTCTCAAGCCATTGGGCGATAGAGTGTTGGTGAAGATCAAAACAGCTGAGGAGAAGACATCAGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057767631.1
MAAAQLTSAASSISAAKGFASFEGLRATQSVNIASFSPLKQNGLSFRSFRGLVVKAATAVAPKYTTLKPLGDRVLVKIKTAEEKTSGGILLPTVAQSRPQGGEVVAVGEGRTIGKNKVEISLENGTQVVYSKYAGTEVEFNGTNHLILKEDDIVGILETDDIKDLKPLNDRVLIKVAVAEEKTAGGLYLTDASKEKPSIGTVVAVGPGPLDEEGNRKPLSVAPGNSVLYSKYAGNDFKGGDGSEYIALRASDVMAVLS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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