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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002995`

染色体: Chr01 坐标: 48904622-48907276 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002995`
名称	SmilChr01G002995
描述	probable xyloglucan glycosyltransferase 9
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	48904622 - 48907276 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131009244`
GeneID	`131009244`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131009244`
原始查询	`SmilChr01G002995`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable xyloglucan glycosyltransferase 9
产物	probable xyloglucan glycosyltransferase 9
Arabidopsis	`AT4G07960` (CSLC12) Cellulose-synthase-like C12 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826301] identity=91.9; qcov=0.889; evalue=3.97e-89; confidence=high
Rice	`Os03g0770800` (OsCslC9) - identity=91.3; qcov=0.902; evalue=4.59e-90; confidence=high
GO	GO:0005794 (Golgi apparatus); GO:0016757 (glycosyltransferase activity)
KEGG	-
Pfam	PF13506 (Glyco_transf_21); PF13632 (Glyco_trans_2_3); PF13641 (Glyco_tranf_2_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131009244

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	0.80000	`XP_057792501.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.40000	`XP_057792501.1`
3	Peroxisome	过氧化物酶体	0.20000	`XP_057792501.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057792501.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057792501.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:48904917`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B73,C30
`Chr1:48905184`	`AGG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	78	A1,A11,A19,A22,A5,A7,B102,B106,B117,B12,B122,B127,B133,B134,B139,B140,B15,B18,B19,B22,B23,B34,B37,B40,B41,B42,B43,B48,B50,B52,B53,B55,B58,B59,B6,B60,B62,B63,B68,B75,B76,B79,B80,B86,B87,B88,B94,B96,B97,B99,C13,C15,C21,C23,C24,C25,C26,C27,C3,C31,C33,C34,C35,C39,C49,C50,C54,C55,C59,C63,C73,C76,C77,C81,C83,C86,C87,D8
`Chr1:48905191`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	18	A15,A21,B123,B129,B136,B23,B26,B40,B48,B55,B8,B81,B88,C23,C25,C34,C43,C7
`Chr1:48907269`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A4,B34,B6,D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057792501.1

153 aa

153

Glyco_transf_21

Glyco_trans_2_3

Glyco_tranf_2_3

PF13506 Glyco_transf_21 5-133 aa PF13632 Glyco_trans_2_3 5-146 aa PF13641 Glyco_tranf_2_3 17-120 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057792501.1`	Pfam	`PF13506`	Glyco_transf_21	Domain	5	133	7.7e-06	25.7	Glycosyl transferase family 21
`XP_057792501.1`	Pfam	`PF13632`	Glyco_trans_2_3	Domain	5	146	9.3e-16	58.9	Glycosyl transferase family group 2
`XP_057792501.1`	Pfam	`PF13641`	Glyco_tranf_2_3	Domain	17	120	7.5e-10	39.6	Glycosyltransferase like family 2

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057936518.1
ATGGCTACGGATAATGATGAAGTAGGGCTGGTCCAGGCAAGGTGGTCATTTGTGAACAAGGATGAGAATCTACTAACAAGGTTGCAGCTCATCAATTTGGCATTTCATTTTGAAGTGGAGCAGCAGGTTAATGGACATTTCCTCAATTTCTTCGGGTTTAATGGGACTGCCGGAGTTTGGAGGATTAAGGCGTTGGACGAATCTGGTGGTTGGATGGAGAGGACCACTGTTGAGGACATGGACATTGCAGTCCGCGCTCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131009244
ATGGCTACGGATAATGATGAAGTAGGGCTGGTCCAGGCAAGGTGGTCATTTGTGAACAAGGATGAGAATCTACTAACAAGGTTGCAGCTCATCAATTTGGCATTTCATTTTGAAGTGGAGCAGCAGGTTAATGGACATTTCCTCAATTTCTTCGGGTTTAATGGGACTGCCGGAGTTTGGAGGATTAAGGCGTTGGACGAATCTGGTGGTTGGATGGAGAGGACCACTGTTGAGGACATGGACATTGCAGTCCGCGCTCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057792501.1
MATDNDEVGLVQARWSFVNKDENLLTRLQLINLAFHFEVEQQVNGHFLNFFGFNGTAGVWRIKALDESGGWMERTTVEDMDIAVRAHLHGWKFVFLNDVECQCELPESYEAYRKQQHRWHSGPMQLFRLCLPAIIKSKVRYLMMFILGDSLDR

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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