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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003049`

染色体: Chr01 坐标: 49452411-49457100 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003049`
名称	SmilChr01G003049
描述	7-dehydrocholesterol reductase
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	49452411 - 49457100 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130989568`
GeneID	`130989568`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130989568`
原始查询	`SmilChr01G003049`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	7-dehydrocholesterol reductase
产物	7-dehydrocholesterol reductase
Arabidopsis	`AT1G50430` (DWF5) Ergosterol biosynthesis ERG4/ERG24 family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841465] identity=82.8; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0465400` - identity=80; qcov=0.998; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005789 (endoplasmic reticulum membrane); GO:0009918 (GO:0009918); GO:0016126 (sterol biosynthetic process); GO:0016132 (brassinosteroid biosynthetic process); GO:0016628 (oxidoreductase activity, acting on the CH-CH group of donors, NAD or NADP as acceptor)
KEGG	smil00100 (Steroid biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01222 (ERG4_ERG24)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130989568

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057769525.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	1.00000	`XP_057769525.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057769525.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057769525.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057769525.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:49454697`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr1:49455006`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	17	A7,B1,B100,B109,B120,B139,B40,B7,B72,C26,C4,C46,C47,C52,C61,C72,C73
`Chr1:49455366`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B126,B65
`Chr1:49455412`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C36
`Chr1:49456228`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A6,B66,B87,C82,D6
`Chr1:49456234`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B114,B82,C56,C81

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057769525.1

435 aa

218

435

ERG4_ERG24

PF01222 ERG4_ERG24 50-435 aa

XP_057769529.1

430 aa

215

430

ERG4_ERG24

PF01222 ERG4_ERG24 50-430 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057769525.1`	Pfam	`PF01222`	ERG4_ERG24	Family	50	435	1.9e-86	291.3	Ergosterol biosynthesis ERG4/ERG24 family
`XP_057769529.1`	Pfam	`PF01222`	ERG4_ERG24	Family	50	430	6.6e-80	269.7	Ergosterol biosynthesis ERG4/ERG24 family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057913542.1
GAATAATCCCAACTTATTAATATACTAGTATTTGTAGAATAGAGAATATGATAGTGGCGGCCACGCGTAATGTCACGTGACCCACCGAAATATCAAATTGCAAAAATTTCCATTGCACTGTCTCTGTTCCTTTTCCACAAAATTCATAATTTAAGAGTGTTTTGGCGTCTGCTTCTGATTTGCAGTCAAGAATTTCTCACTTCACTCTCAGCTTTCACCAAAGAAGAAGAAGAAAATGGGGGCAGAAGCGGATATGGTGC...

XM_057913546.1
ACCGAAATATCAAATTGCAAAAATTTCCATTGCACTGTCTCTGTTCCTTTTCCACAAAATTCATAATTTAAGAGTGTTTTGGCGTCTGCTTCTGATTTGCAGTCAAGAATTTCTCACTTCACTCTCAGCTTTCACCAAAGAAGAAGAAGAAAATGGGGGCAGAAGCGGATATGGTGCACGCGCCATTGGTCACTTACGCCTCTATGCTATCTCTCCTCTCTCTCTGTCCGCCTTTTGTTATTCTTCTATGGTATACTATG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130989568
ATGGGGGCAGAAGCGGATATGGTGCACGCGCCATTGGTCACTTACGCCTCTATGCTATCTCTCCTCTCTCTCTGTCCGCCTTTTGTTATTCTTCTATGGTATACTATGGTGCATGCTGATGGGTCCGTGTTGCAAACGTGGGATTACTTAAGGCAGCATGGCCAACAGGGATTGATCGATATCTGGCCGAAACCCACTGCCACTGCGTGGAAAATCATTGCTTGTTATGGGGCATTTGAGGCTGCACTGCAGCTTCTGCT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057769525.1
MGAEADMVHAPLVTYASMLSLLSLCPPFVILLWYTMVHADGSVLQTWDYLRQHGQQGLIDIWPKPTATAWKIIACYGAFEAALQLLLPGKRVEGPISPAGNRPVYKANGVLAYVVTLVTYLGLWWFGIFNPTIVYDHLGEIFSALIFGSFVFCIFLYIKGHVAPSSADSGSCGNLIIDFYWGMELYPRIGENFDIKVFTNCRFGMMSWAVLAVTYCVKQYETYGKLSDSMLVNTILMLVYVTKFFWWEAGYWNTMDIAHD...

XP_057769529.1
MGAEADMVHAPLVTYASMLSLLSLCPPFVILLWYTMVHADGSVLQTWDYLRQHGQQGLIDIWPKPTATAWKIIACYGAFEAALQLLLPGKRVEGPISPAGNRPVYKANGVLAYVVTLVTYLGLWWFGIFNPTIVYDHLGEIFSALIFGSFVFCIFLYIKVSVHGNMKRFNALSFFQGMELYPRIGENFDIKVFTNCRFGMMSWAVLAVTYCVKQYETYGKLSDSMLVNTILMLVYVTKFFWWEAGYWNTMDIAHDRAGFY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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